多种生物和非生物胁迫条件下菜螟(Maruca vitrata F.,鳞翅目:草螟科)qRT-PCR精确定量的候选参考基因标准化

《International Journal of Tropical Insect Science》:Normalization of candidate reference genes for precise qRT-PCR quantification in Maruca vitrata F. (Lepidoptera: Crambidae) under multiple biotic and abiotic stress regimes

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月04日 来源:International Journal of Tropical Insect Science 1.3

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   摘要Maruca vitrata Fabricius 是多种豆科作物的一种毁灭性害虫。在农药喷洒、寄主植物缺失以及极端温度等环境因素的作用下,该害虫与其作物环境之间演化出了一种复杂的适应性关系。该害虫对杀虫剂抗性的快速发展已成为可持续管理的一大挑战。在此背景下,基于实时定量

  

摘要

Maruca vitrata Fabricius 是多种豆科作物的一种毁灭性害虫。在农药喷洒、寄主植物缺失以及极端温度等环境因素的作用下,该害虫与其作物环境之间演化出了一种复杂的适应性关系。该害虫对杀虫剂抗性的快速发展已成为可持续管理的一大挑战。在此背景下,基于实时定量 PCR(qRT-PCR)的解毒相关基因表达分析是了解杀虫剂抗性分子基础并制定改进管理策略的一种有价值的方法。然而,qRT-PCR 数据的准确标准化依赖于选择合适的内参基因,即那些在不同实验条件下表达稳定的基因。本研究评估了 M. vitrata 在多种生物和非生物条件下六个候选内参基因 EF1α、Act、α-tub、GAPDH、Cal 和 Ubiq 的表达稳定性。表达数据采用 geNorm、NormFinder、BestKeeper、比较 ΔCt 法以及在线工具 RefFinder 进行了分析。geNorm 鉴定出 Act 和 GAPDH 为最稳定的基因(M = 0.765),NormFinder 和 BestKeeper 将 α-tub 评为最稳定的基因(SV = 0.581;SD ± 1.24),而 ΔCt 法也将 Act 鉴定为最稳定的基因(SD = 0.66)。综合分析表明,Act 和 α-tub 在所施加的所有条件下均保持稳定。使用 geNorm 进行的配对变异分析显示,两个内参基因即可满足可靠的标准化需求,因为 V2/3 值低于 0.15。因此,建议将 Act 和 α-tub 作为 M. vitrata 基因表达研究中 qRT-PCR 准确标准化的合适内参基因。

图形摘要

Maruca vitrata Fabricius 是多种豆科作物的一种毁灭性害虫。在农药喷洒、寄主植物缺失以及极端温度等环境因素的作用下,该害虫与其作物环境之间演化出了一种复杂的适应性关系。该害虫对杀虫剂抗性的快速发展已成为可持续管理的一大挑战。在此背景下,基于实时定量 PCR(qRT-PCR)的解毒相关基因表达分析是了解杀虫剂抗性分子基础并制定改进管理策略的一种有价值的方法。然而,qRT-PCR 数据的准确标准化依赖于选择合适的内参基因,即那些在不同实验条件下表达稳定的基因。本研究评估了 M. vitrata 在多种生物和非生物条件下六个候选内参基因 EF1α、Act、α-tub、GAPDH、Cal 和 Ubiq 的表达稳定性。表达数据采用 geNorm、NormFinder、BestKeeper、比较 ΔCt 法以及在线工具 RefFinder 进行了分析。geNorm 鉴定出 Act 和 GAPDH 为最稳定的基因(M = 0.765),NormFinder 和 BestKeeper 将 α-tub 评为最稳定的基因(SV = 0.581;SD ± 1.24),而 ΔCt 法也将 Act 鉴定为最稳定的基因(SD = 0.66)。综合分析表明,Act 和 α-tub 在所施加的所有条件下均保持稳定。使用 geNorm 进行的配对变异分析显示,两个内参基因即可满足可靠的标准化需求,因为 V2/3 值低于 0.15。因此,建议将 Act 和 α-tub 作为 M. vitrata 基因表达研究中 qRT-PCR 准确标准化的合适内参基因。

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