基于mtCOI基因标记的印度泰米尔纳德邦安普按蚊（双翅目：蚊科）种群结构与单倍型网络分析及其全球遗传关系

《International Journal of Tropical Insect Science》：Population structure and haplotype network analysis of Anopheles peditaeniatus (Diptera: Culicidae) from Tamil Nadu, India, using mtCOI gene marker and its global genetic relationships

　　

摘要

Anopheles peditaeniatus属于< *Hyrcanus组和< *Lesteri亚组，广泛分布于东洋区和古北区，可将日本脑炎病毒和丝虫病传播给人类。本研究对来自印度塔米尔纳德邦的< *An. peditaeniatus（Hyrcanus组）进行了系统发育、系统地理和单倍型网络分析。使用BioEdit进行序列质量分析和末端修剪后，通过MUSCLE算法进行多序列比对，并采用UPGMA聚类方法构建了系统发育树。从NCBI GenBank中检索了高度相似的序列。分别使用邻接法（NJ）和最大似然法（ML）（含1000次Bootstrap重复）来估计不同种群间的种间和种内遗传距离。共分析了81条An. peditaeniatus序列，鉴定出17个单倍型，整体遗传多样性中等（Hd?=?0.873；π?=?0.006）。印度种群变异较低，以Hap_2为主；斯里兰卡表现出最高的多样性，具有多个特有单倍型。泰国、中国和巴基斯坦表现出中等至较高的多样性；越南和马来西亚尽管采样有限，但仍贡献了稀有单倍型。所有序列均聚类并反映了共同的祖先关系，表明南亚和东南亚之间存在基因流动，但也存在局部分化。共享的单倍型包括Hap_1、Hap_2、Hap_3、Hap_6、Hap_7、Hap_13和Hap_14。Fu's Fs负值提示种群扩张或遗传漂变，非显著的Tajima's D值（P?>?0.05）表明中性进化。总体而言，遗传结构显示出聚集和共享的单倍型，并具有区域性的多样性热点，这凸显了其对媒介监测和防控项目的重要性。