来自西太平洋断面的表层海水宏基因组及 194 个微生物基因组数据集

《Scientific Data》：A dataset of surface seawater metagenomes and 194 microbial genomes from a western Pacific Ocean transect

　　

摘要

海洋微生物驱动着全球生物地球化学循环，然而大多数微生物难以培养且特征尚不明确。微生物群落结构沿环境梯度变化显著，尤其是在贫营养开阔海域与营养丰富的近岸区域之间。然而，跨此类自然梯度的宏基因组学见解仍然有限，尤其是在西太平洋地区。本研究对西太平洋从开阔海域到近岸地带的一条采样带上收集的七个表层海水样本应用了基因组分辨的宏基因组学分析。测序产生了80.16 Gbp的数据，实现了194个物种水平细菌和古菌宏基因组组装基因组（MAGs）的重建。其中，8个符合高质量草图基因组标准，186个根据MIMAG标准（完整性≥50%，污染率≤10%）被归类为中等质量草图基因组。基于序列的分类学特征分析和基因组分辨的二元分组均揭示了样本间细菌和古菌群落结构的差异。Pseudomonadota、Bacteroidota和Marinisomatota在过渡区和近岸样本中相对更为丰富，而Cyanobacteriota在开阔海域样本中更为丰富。古菌门在过渡区和近岸样本中相对更为丰富。总体而言，本数据集为西太平洋提供了区域特异性的基因组分辨资源，并支持对连续开阔海域至近岸梯度的微生物群落结构进行研究。