智利圣地亚哥公立医院和私立医院临床分离的弯曲杆菌的基因组与流行病学比较分析

《Scientific Reports》：Genomic and epidemiological comparative analysis of clinical Campylobacter isolates from public and private healthcare centers in Santiago, Chile

　　

摘要

由于监测和诊断能力有限，在拉丁美洲，弯曲杆菌病仍然被低估。为此，研究人员对比了智利圣地亚哥两个不同医疗环境中的弯曲杆菌菌株：一家公立儿童医院和一家私立三级诊所。通过基因组分析发现，菌株与宿主之间的关联在不同社会经济群体中存在差异：与家禽相关的菌株（如ST-353和ST-443复合体）在所有分析的人群中都频繁出现，尤其是在公共卫生机构中更为常见；相比之下，与牛相关的菌株（ST-22复合体）主要从收入较高的患者体内分离出来。这些发现首次证明了在智利低收入儿童群体中弯曲杆菌感染的普遍性，表明该病原体是导致该地区各社会经济群体中胃肠炎的重要原因。此外，研究发现6型分泌系统（T6SS）与临床严重程度之间存在关联，其中某些效应因子（CJ488_00960c和CJ488_00961）与脱水症状显著相关。报告还显示，对这些菌株而言，四环素（tetO）和氟喹诺酮类药物（gyrA T86I）的耐药性非常普遍。这些数据揭示了同一城市内不同社会经济群体的主要传播途径，为相关部门在应对潜在疫情时提供了宝贵信息，并强调了在智利实施综合基因组监测的迫切性。