跟踪入住重症监护病房患者的上呼吸道微生物组动态：一项初步研究的启示

《Scientific Reports》：Tracking upper respiratory microbiome dynamics in patients admitted to intensive care unit: insights from a pilot study

　　

摘要

重症监护病房（ICU）中的患者极易发生院内感染，然而关于非插管呼吸衰竭患者的呼吸道微生物组动态的数据仍然有限。在这项初步研究中，研究人员在三个时间点对21名ICU患者的上呼吸道（URT）微生物群进行了检测：抗生素治疗开始前、治疗早期和治疗后期。通过对口腔咽拭子进行16S rRNA扩增子测序，并进行分类学、功能预测和网络分析，发现患者入住ICU后，包括接受抗生素治疗期间，其呼吸道微生物多样性逐渐下降。共生菌属（如Neisseria、Haemophilus和Rothia）的数量减少，而机会性病原体（如Acinetobacter、Klebsiella和Staphylococcus）的数量则增加。功能分析显示微生物群发生了与应激相关的变化，且与耐药性相关的代谢途径得到增强；网络分析表明生态系统的稳定性降低，病原体的核心地位逐渐上升。这些发现表明，在ICU住院期间上呼吸道微生物群会迅速失衡，强调了纵向、无创的微生物组监测在评估重症患者病原体相关菌群失调方面的价值，这对未来感染风险评估具有重要意义。