空间转录组学研究揭示了猕猴大脑皮层中呈层状分布且具有细胞类型特异性的A-to-I RNA编辑特征

《Nature Communications》：Spatial transcriptomics reveals laminar and cell-type-specific A-to-I RNA editing signatures in the macaque cortex

　　

摘要

ADAR介导的A到I RNA编辑对神经元的正常功能至关重要。然而，其在大脑皮层中的空间分布特征仍很大程度上未被探索。为了解决这一问题，我们开发了SRDRE这一分析框架，用于在空间转录组数据中识别RNA编辑位点。通过对成年猕猴大脑皮层中142个具有空间注释区域的4000多万个细胞进行分析，我们揭示了不同层次和细胞类型特有的RNA编辑模式。值得注意的是，神经元中的RNA编辑程度与视觉和体感系统中的皮层层次结构相关。在大多数区域中，小清蛋白神经元（parvalbumin neurons）表现出最高的编辑活性。此外，我们在离子通道基因中发现了特定于灵长类动物的编辑位点，尤其是在前额叶皮层的兴奋性神经元亚型中。最后，在一项初步的探索性分析中，我们观察到表现出抑郁样行为的猕猴的背外侧前额叶皮层深层中RNA编辑发生了改变，这表明两者之间可能存在某种联系，值得进一步研究。这些发现强调了RNA编辑的作用及其对皮层特化、大脑进化以及神经精神疾病可能产生的影响。