Pammene nemorosa完整线粒体基因组测序及其在Grapholitini族中的系统发育位置

《Scientific Reports》：The complete mitochondrial genome of Pammene nemorosa (Lepidoptera, Tortricidae) and its phylogenetic placement within Grapholitini

　　

摘要

苹果蠹蛾防治中使用的东方果实蛾（Grapholita molesta，鳞翅目：卷蛾科）性信息素诱捕器可能对Pammene nemorosa产生跨属吸引，从而损害苹果园害虫监测的可靠性，然而这一行为重叠的进化背景尚不清楚。在此，我们对P. nemorosa的第一个完整线粒体基因组（线粒体基因组）进行了测序和表征，并评估了其在Grapholitini族中的系统发育位置。该环状线粒体基因组全长15,457 bp，包含标准的37个基因集，包括13个蛋白编码基因、22个转运RNA基因和两个核糖体RNA基因，基因排列顺序为双叉卷蛾科鳞翅目的典型特征。该基因组表现出显著的A+T偏好性（80.1%），其484 bp的控制区包含一个约215 bp序列单元的串联重复，每个重复拷贝均以ATAGA基序标记。基于邻接法（Neighbor-Joining）、最大似然法（Maximum Likelihood）和贝叶斯推断（Bayesian Inference）的系统发育分析一致地将P. nemorosa恢复为Grapholita谱系（G. dimorpha + G. molesta）的姐妹群，且具有强贝叶斯支持（后验概率 = 0.999），凸显了其线粒体系统发育位置与其目前在Pammene属中的形态学分类之间可能存在的矛盾。这些发现为P. nemorosa建立了第一个完整线粒体基因组资源，并提供了阐明其与Grapholita物种密切进化关系的系统发育框架。虽然仅凭线粒体数据无法确定异种信息素吸引的机制，但此处建立的基因组资源为未来结合核基因组学、转录组学和化学生态学的综合性研究提供了基线，并有助于更全面地理解Grapholitini族内的进化关系和生态相互作用。