结合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析的结果，揭示了NUPR1在肿瘤微环境及癌症发展中的作用

《Scientific Reports》：Integration of bulk and single-cell RNA sequencing analyses elucidates the role of NUPR1 in tumour microenvironment and cancer development

　　

摘要

核蛋白1（NUPR1）是一种多功能、应激诱导的转录因子，已被视为癌症治疗的潜在靶点。然而，对其在所有癌症类型中的全面研究仍十分匮乏。在本研究中，我们利用癌症基因组图谱（TCGA）和基因型-组织表达（GTEx）数据库的多组学数据，评估了NUPR1在33种癌症类型中的表达情况、预后意义、基因组特征及免疫学特性。研究发现，NUPR1在多种癌症中存在显著异常调控，其表达水平也与某些癌症类型的预后密切相关。从机制上看，NUPR1与基因组不稳定性、DNA甲基化、肿瘤浸润的免疫细胞、DNA修复及细胞凋亡等多种生物学过程存在关联。为探讨NUPR1在肿瘤微环境（TME）中的作用，我们分析了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，发现NUPR1主要在上皮细胞和巨噬细胞中表达，而在淋巴细胞、树突状细胞或肥大细胞中则无明显表达。在BRCA癌系中，NUPR1的表达与上皮细胞干性有关，且上皮细胞和巨噬细胞中NUPR1的高表达预示着较差的预后。此外，NUPR1还被确定为药物敏感性的潜在生物标志物以及BRCA癌症的风险因素。通过ZZW-115抑制剂抑制BRCA细胞中的NUPR1活性后，观察到抗癌效应和放疗增敏效果，包括抑制细胞的迁移、增殖和侵袭能力，促进巨噬细胞向M1型极化（而非M2型极化），同时增强辐射诱导的细胞凋亡、DNA损伤及活性氧（ROS）的产生。