《Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases》：Pulmonary microbial profiles in slaughtered Duolang sheep from Kashgar stratified by gross lung lesions: implications for respiratory disease surveillance
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•肺炎患者的肺部主要表现为化脓性肺炎。•在39个肺炎肺部样本中，至少有20个样本检测出两种或两种以上的非大肠杆菌属细菌。•在120个检测的分离株中，有17个表现出多重耐药性。•Mycoplasma ovipneumoniae的阳性率在肺炎患者中更高。引言呼吸道疾病是严重影响绵羊生
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肺炎患者的肺部主要表现为化脓性肺炎。
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在39个肺炎肺部样本中，至少有20个样本检测出两种或两种以上的非大肠杆菌属细菌。
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在120个检测的分离株中，有17个表现出多重耐药性。
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Mycoplasma ovipneumoniae的阳性率在肺炎患者中更高。
引言
呼吸道疾病是严重影响绵羊生产稳定性和导致经济损失的重要因素[1]、[2]、[3]。绵羊呼吸道疾病的发生是多因素共同作用的结果，管理条件、环境压力、宿主相关因素以及呼吸道病原体之间的相互作用都会影响动物对感染的易感性和疾病的发展[4]、[5]。在这一多因素过程中，经常检测到诸如Mannheimia haemolytica和Pasteurella multocida等细菌病原体，以及Mycoplasma属细菌[6]、[7]、[8]、[9]、[10]。
由于多种呼吸道病原体的共同作用，人们越来越关注肺部微生物群落，而不仅仅是单一病原体。研究表明，下呼吸道栖息着独特的微生物群落，并且健康绵羊与肺炎绵羊的肺部微生物组成存在差异[11]、[12]、[13]、[14]。了解这些微生物特征有助于更全面地理解与肺部病变相关的微生物变化，并补充传统的病原体检测方法，从而更好地研究绵羊呼吸道疾病[13]、[15]。
除了微生物组成外，从呼吸道中分离出的细菌对抗微生物药物的敏感性对于疾病管理和监测也具有重要意义。一些与绵羊呼吸道疾病相关的细菌，包括P. multocida、Escherichia coli和Pseudomonas aeruginosa，可能对多种抗微生物药物具有耐药性[16]、[17]。尽管大多数绵羊呼吸道病原体主要对兽医领域有影响，但在食品生产动物中发现的耐药性和机会性细菌可能通过动物接触、屠宰和加工环境或食物链对公共卫生产生更广泛的影响[18]、[19]、[20]。综合监测呼吸道微生物群落和抗微生物药物耐药性有助于控制绵羊的呼吸道疾病，并为“同一个健康”（One Health）风险评估提供相关数据。
本研究基于肺部病变的肉眼观察结果，通过病理学检查、细菌分离、Mycoplasma ovipneumoniae检测、抗微生物药物敏感性测试和16S rRNA基因测序等方法，分析了喀什地区屠宰的Duolang绵羊的肺部微生物群落。研究结果为绵羊呼吸道疾病的监测和控制提供了重要信息。
章节摘要
样本采集
在新疆喀什（39°28'N, 75°59'E）的屠宰场，从49只年龄在2至5岁的Duolang绵羊身上采集了肺部样本（采集时间在屠宰后3小时内）。样本数量的选择参考了以往的绵羊肺炎研究及可供使用的动物情况，其规模与之前的病理学、细菌学和肺部微生物群研究相当[13]、[21]、[22]。部分动物表现出轻微的咳嗽和其他呼吸道症状。
肺部病变研究
根据屠宰场的快速CPS评估，CPS得分为0的10个肺部样本被归类为健康组（组H），而得分为1-2的39个样本被归类为肺炎病变组（组P）。肉眼观察发现，病变主要分布在右侧肺叶和中间肺叶，右侧尾叶受累较少。在39个肺炎样本中，有8个样本存在肺部脓肿（占比20.5%；95%置信区间：10.8-35.5%）。
讨论
本研究综合分析了绵羊的肺部病理特征、细菌分离情况、抗微生物药物耐药性以及肺部微生物群落。在肺炎肺部样本中观察到多种细菌的共存现象，且部分分离株表现出多重耐药性，这突显了在绵羊生产系统中进行呼吸道病原体和抗微生物药物耐药性监测的重要性[18]、[28]、[29]。
反刍动物肺炎是一种复杂的疾病，涉及宿主的免疫系统……
结论
本研究综合分析了屠宰绵羊的肺部病理学特征、细菌共存情况、M. ovipneumoniae检测结果、抗微生物药物耐药性以及肺部微生物群落。呼吸道病原体与多重耐药细菌的共存表明，继续进行疾病监测、合理使用抗微生物药物以及改进绵羊呼吸道疾病的防控措施至关重要。从“同一个健康”（One Health）的角度来看，对呼吸道病原体进行综合监测……
伦理声明
本研究获得了中国农业大学动物福利与伦理委员会的批准。动物参与了该研究，并已获得书面同意（编号：AW00213202-2-2）。
关于人工智能使用的声明
在研究过程中，作者使用了ChatGPT（OpenAI）辅助语言编辑、提升文本可读性和优化科学写作。所有由AI辅助生成的内容均经过作者审核和修改，作者对文本的科学准确性、解释性、原创性和内容负全责。
资金支持
本研究得到了新疆维吾尔自治区重点研发计划（项目编号2022B02056-2）的支持。资助方未参与研究设计、数据收集与分析、文章撰写或决定发表该文章。
CRediT作者贡献声明
Mengyue Li：方法学研究、数据管理。Luo Yang：方法学研究、实验设计。Yuxin Qi：数据可视化。Zixuan Wang：实验设计、数据管理。Rongzheng Wu：软件开发。Mingwei Mao：资源协调。Jing Li：文章撰写及审改、监督、资金筹集、概念制定。Shiyu Duan：初稿撰写、资源提供、方法学研究、数据管理。Yiping Zhu：文章撰写及审改、监督、项目管理、概念制定。
利益冲突声明
作者声明不存在任何可能影响本文研究的潜在利益冲突或个人关系。
致谢
本研究得到了新疆维吾尔自治区重点研发计划（项目编号2022B02056-2）的支持。
Shiyu Duan|Luo Yang|Mengyue Li|Zixuan Wang|Yuxin Qi|Mingwei Mao|Rongzheng Wu|Yiping Zhu|Jing Li
