加拿大里穆斯基医疗机构 Legionella anisa 分离株的全基因组测序与群体结构分析

《FEMS Microbiology Letters》：Comparative genomic analysis reveals distinct population structure in Legionella anisa

　　

摘要

Legionella anisa 已频繁从人工水系统中分离出来；然而，与Legionella pneumophila相比，其群体结构仍缺乏研究。在此，我们生成了从加拿大里穆斯基一家医疗机构中回收的四个L. anisa分离株的完整基因组序列。此外，通过将本研究中生成的基因组与公开的L. anisa基因组进行比较基因组分析，对该物种的群体结构进行了研究。全基因组系统发育分析揭示了三个明显的进化支的存在，这些进化支之间由显著的遗传分歧（约500个SNP）分隔，其中里穆斯基分离株形成一个紧密聚集的群体，提示为克隆谱系。比较泛基因组分析表明核心基因组中度保守，同时伴随高度可变的辅助基因组（约50%）。本研究中表征的分离株携带多个质粒，编码与接合、重金属抗性及其他应激相关功能相关的基因，提示其在环境持久性中可能发挥潜在作用。先前的研究表明，L. anisa可在原生动物宿主细胞内增殖，但结果因宿主物种而异。在测试条件下，我们的分离株在Acanthamoeba castellanii中显示有效增殖，但在Vermamoeba vermiformis中未显示有效增殖。总之，这些发现强调了这种研究不足的Legionella物种的基因组多样性，并为未来关于环境持久性和潜在致病性的研究提供了框架。