基于组织信息的ctDNA检测在头颈部鳞状细胞癌中的应用性能

《JAMA Otolaryngology–Head & Neck Surgery》：Tissue-Informed ctDNA Assay Performance in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma

　　

关键点

问题　基于组织信息的循环肿瘤DNA（ctDNA）检测方法在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的预处理检测率和监测性能如何？

研究结果　在这项针对168名成年人的队列研究中，初步检测率为92.2%。在监测期间，灵敏度为95.2%；特异性为100%；阳性预测值为100%，阴性预测值为99.4%，在人乳头瘤病毒（HPV）阳性与阴性患者组间观察到了相似的结果。

意义　基于组织信息的ctDNA检测方法具有优异的性能指标，支持将其纳入HNSCC的疾病监测方案中。

摘要

重要性　液体活检正成为检测和监测头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的一种强大生物标志物。关于HNSCC中循环肿瘤DNA（ctDNA）的最有力证据来自那些检测与人乳头瘤病毒（HPV）相关HNSCC的、不依赖于组织类型的检测方法。在HPV阴性的HNSCC中，由于缺乏广泛共享的变异靶点，因此无法使用这类检测方法。一种新兴的替代方法是基于组织信息的检测方法，该方法利用患者特有的肿瘤变异谱型来实现血液中ctDNA的个性化检测。

目的　比较一种商业化的基于组织信息的检测方法与标准组织活检方法在HPV阳性和HPV阴性HNSCC的预处理和监测阶段中的检测性能。

研究设计、环境和参与者　这是一项回顾性队列研究，研究对象为2024年12月至2026年3月期间在大型城市三级医疗机构接受基于组织信息ctDNA检测的HNSCC患者。数据分析于2026年3月至4月进行。

研究方法　通过细针穿刺或手术活检获取肿瘤组织样本，用于生成个性化的ctDNA检测资料，以便后续进行血液ctDNA检测。

主要结果和指标　预处理阶段的指标包括：检测率、漏检率和组织样本不足率。监测阶段的指标包括：每次检测的灵敏度、特异性、阴性预测值（NPV）和阳性预测值（PPV）。

研究结果　预处理组共有77名患者（平均年龄65.0岁[标准差12.6岁]；28名女性[36%]，49名男性[64%]）；监测组共有107名患者（平均年龄65.0岁[标准差12.1岁]；28名女性[26%]，79名男性[74%]。监测组患者的术后中位随访时间为18个月（范围11-39个月）。在初步预处理阶段，77名患者中有71名（92.2%）检测出ctDNA阳性。在监测阶段，该检测方法的每次检测灵敏度为95.2%（21名患者中有20名；95%置信区间83.3%-100%），特异性为100%（157名患者中有157名；95%置信区间100%-100%），阳性预测值为100%（20名患者中有20名；95%置信区间100%-100%），阴性预测值为99.4%（158名患者中有157名；95%置信区间97.9%-100%）。在患者个体水平上，灵敏度为94.4%（18名患者中有17名；95%置信区间72.7%-99.9%），特异性为100%（89名患者中有89名；95%置信区间95.9%-100%），阳性预测值为100%（17名患者中有17名；95%置信区间80.5%-100%），阴性预测值为98.9%（90名患者中有89名；95%置信区间93.0%-99.8%）。

结论和相关性　在这项队列研究中，基于组织信息的ctDNA检测方法在预处理阶段的样本生成能力和监测阶段的性能指标均表现出色。然而预处理组中仍有7.8%的检测失败率，其原因尚不清楚。这些数据支持将该检测方法作为HNSCC疾病监测的有效工具。