倭黑猩猩肠道微生物组的老化过程反映人类的模式

《npj Biofilms and Microbiomes》：Ageing processes in the bonobo gut microbiome mirror human patterns

　　

摘要

衰老与人体肠道细菌微生物组的变化密切相关：随年龄增长，微生物组多样性增加，个体内和个体间变异性增大，核心细菌属减少，稀有属扩张。尽管近期模式生物的研究证据表明，这些模式可能源于随机过程而非宿主驱动的筛选，但终生暴露因素（即暴露组）的作用仍知之甚少。本研究对来自野生和圈养群体的165只倭黑猩猩（Pan paniscus，年龄2至71岁）的肠道微生物组随年龄变化的动态特征进行了表征，为区分灵长类动物肠道微生物组中保守性与情境依赖性衰老轨迹提供了比较框架。在两种环境中，衰老均与微生物多样性增加和核心微生物组丰度降低相关，同时低丰度类群上升，重现了人类中观察到的模式。值得注意的是，圈养倭黑猩猩的微生物组不稳定性与独特性随年龄增加而升高，而野生倭黑猩猩则无此现象，这一模式与仅限于工业化人类群体的观察结果一致。此外，个体一生中累积暴露于不同环境对微生物组的独特性贡献显著。我们的发现表明，虽然肠道微生物组的衰老在灵长类动物中广泛保守，但其表现形式受环境情境的调节，为理解人类微生物衰老的进化与生态驱动因素提供了洞察。