通过小 RNA 和降解组测序鉴定中国枣中抗冻响应微小 RNA 及其靶标
《International Journal of Molecular Sciences》:Identification of Freezing-Responsive microRNAs and Their Targets in Chinese Jujube by Small RNA and Degradome Sequencing
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时间:2026年09月05日
来源:International Journal of Molecular Sciences 5.6
摘要
枣树果实仍是华北地区的主要水果,然而其地理分布和产量因冬季冻害而受到显著限制。大量研究已强调微小RNA(miRNAs)在植物低温胁迫应答中发挥关键的调控作用。然而,在Ziziphus jujuba Mill中,参与低温响应的具体miRNAs及其相关的基因网络尚不明确。本研究利用高通量测序技术,分析了4 °C和?30 °C低温处理枝条的小RNA文库。我们共鉴定出342个miRNAs,其中包括123个已知miRNAs和219个新型miRNAs。差异表达分析表明,在低温条件下,共有177个miRNAs发生了显著变化。其中,在较不耐寒品种中观察到miR319的特异性上调,而在敏感品种中观察到miR6483的上调。通过降解组测序,我们共鉴定出1551个靶基因,涉及299个miRNAs的3059个独特的miRNA靶标互作对。利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的功能分析表明,这些靶基因主要与转录调控、代谢途径和遗传信息处理相关。通过综合分析,我们锁定了11个与枣树冷胁迫相关的基因,对应9个miRNAs,并通过5′-RACE分析验证了7个miRNAs的7个靶基因。这些miRNAs可能在枣树冷胁迫中发挥关键的调控功能。本研究首次系统鉴定了Ziziphus jujuba Mill低温胁迫应答中的miRNAs及其靶基因,为深入分析枣树抗寒的分子机制及抗寒育种提供了重要资源。
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