综述：关于基因组学方法在应对枣椰树（Phoenix dactylifera L.）环境因素响应中的应用综述：当前趋势与未来方向

《Journal of Crop Health》：A Review of Omics Approaches Against Environmental Factor Responses in Date Palm (Phoenix dactylifera L.): Current Trends and Future Directions

　　

摘要

Phoenix dactylifera L. 是许多干旱和半干旱地区农业的重要支柱，但由于气候变化和多种病害的压力，它正面临日益严峻的挑战。非生物胁迫与生物胁迫的叠加共同成为影响作物生产力的决定性因素。因此，从分子层面理解 Phoenix dactylifera L. 对环境胁迫的响应对于其有效管理和改良至关重要。胁迫耐受机制的解析非常复杂，需要涉及组学层面的信息。在这一背景下，组学领域取得了巨大进展，包括基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学。在迄今为止发表的44项关于枣椰树的组学研究中，转录组学占据主导地位（21项研究，占47.7%），其次是微生物组学/宏基因组学（8项研究，占18.2%）。相比之下，基因组学、蛋白质组学和多组学方法各自仅有4项研究（各占9.1%），而代谢组学则是研究最少的领域（3项研究，占6.8%）。总体而言，研究主要集中在非生物胁迫上（39项研究，占88.6%），而针对生物胁迫的研究仅有5项（占11.4%）。此外，将多组学数据集结合起来以阐明枣椰树胁迫耐受性的复杂遗传、生理和生化基础的工作仍然有限。本文综述了目前关于单个或组合组学策略在解析 Phoenix dactylifera L. 非生物和生物胁迫耐受机制方面的最新进展。同时，也讨论了泛组学方法的重要性及其与人工智能/机器学习和生物信息学工具在未来研究中的应用，这些方法旨在提高枣椰树的抗逆性，并确保其在恶劣环境条件下的可持续产量。