综述：沙蟹及其近缘类群的线粒体群体结构与描述性RNA测序观察：系统综述与荟萃分析

《Aquatic Sciences》：Mitochondrial population structure and descriptive RNA-seq observations in fiddler and allied crabs: a systematic review and meta-analysis

　　招潮蟹及其近缘种是红树林和滩涂生态系统中的关键生物扰动者，然而相关的遗传学和转录组学资源在不同研究和数据库中仍较为分散。我们按照PRISMA指南进行了系统综述和证据综合，使用Fisher Z变换的Φ_ST/F_ST值对群体规模线粒体DNA结构进行了正式的元分析，并将RNA-seq证据作为描述性的研究层面观察结果进行单独总结。系统地理学元分析揭示，热带西大西洋存在强烈的跨流域群体结构；例如，Leptuca thayeri和Uca maracoani的合并Φ_ST约为0.78–0.89，且异质性较低，这与Uca（Minuca）minax内湾群体间较弱的分异（合并Φ_ST约为0.03）以及Uca sindensis流域内外对比几乎无差异形成对比。独立的RNA-seq研究在物种、组织和应激因素特异性的不同背景下，反复报告了与伴侣蛋白介导的应激反应、氧化防御、解毒、离子调节、凋亡/自噬以及繁殖相关的功能类别。由于各RNA-seq数据集在物种、组织、暴露方案、比较设计、注释深度和差异表达分析流程上存在差异，报告的转录组学数值被作为描述性观察结果处理，而非合并估计值或统一的转录组效应量。繁殖相关观察结果被总结为涉及性别分化、卵黄发生和卵巢调控的组织及研究特异性记录，而应激相关观察结果则被总结为情境依赖的途径类别，而非单一保守转录程序的证据。漏斗图诊断和逐一剔除检验仅限于线粒体DNA群体结构元分析部分，用于评估Φ_ST/F_ST对比的稳健性及可能的小样本效应。总体而言，线粒体DNA和RNA-seq的研究结果最好被理解为平行的证据流：线粒体标记支持尺度依赖的群体分化和历史连通性，而RNA-seq研究则提供了关于功能途径类别的描述性和假设生成性观察结果。这些发现可为保护单元划定、水产养殖生物监测以及与"健康"理念相协调的海岸治理提供参考。主要知识空白包括公开核基因组数据稀缺和元数据不均衡；未来工作应将全基因组标记与共同园试验相结合，以区分可塑性表型与遗传适应性。