非酒精性脂肪性肝炎和原发性胆汁性胆管炎中的共同免疫核心基因

《npj Systems Biology and Applications》：Shared immune core genes in nonalcoholic steatohepatitis and primary biliary cholangitis

　　

摘要

非酒精性脂肪性肝炎（NASH）和原发性胆汁性胆管炎（PBC）是慢性肝病，其特征是免疫失调，但它们的共同机制仍不清楚。我们整合了四个GEO肝脏转录组数据集，以识别共同的差异表达基因、功能通路、免疫浸润模式和候选诊断基因。研究方法包括差异表达分析、GO/KEGG和GSEA富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、枢纽基因筛选、ROC分析、自助法验证以及小鼠模型实验。共有25个差异表达基因在NASH和PBC中都存在，并且这些基因在细胞因子介导的信号通路、白细胞趋化作用和炎症通路中表现活跃。IL1RAP、IL1RN、CXCL2、CCL3和CXCL9显示出良好的候选诊断性能，其中IL1RN在这两种疾病中均显示出稳定的鉴别能力。免疫浸润分析显示M1型巨噬细胞异常增多，而CXCL9的表达与M1型巨噬细胞的浸润呈正相关。在NASH和PBC的小鼠模型中，组织学和分子检测结果均证实了选定核心基因的表达增强。这些发现表明NASH和PBC之间存在共同的免疫相关分子特征，并为进一步的临床和机制验证提供了候选生物标志物。