南美洲蝙蝠中发现的一种具有功能性furin切割位点的分歧β冠状病毒

《Nature Communications》：A divergent betacoronavirus with a functional furin cleavage site in South American bats

　　

摘要

蝙蝠是多种 RNA 病毒的自然宿主。Betacoronavirus 属成员，包括严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 型（SARS-CoV-2）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV），因其近期出现的跨物种传播特性而备受关注。然而，目前已知的乙型冠状病毒多样性主要基于来自亚洲、非洲和欧洲的数据，美洲地区的基因组信息则十分有限。在此，我们报道了一种在巴西采样的 Pteronotus parnellii 蝙蝠中发现的乙型冠状病毒的完整基因组。系统发育分析显示，该病毒与已确认的五个 Betacoronavirus 亚属存在显著差异，足以代表一个新的亚属。值得注意的是，该蝙蝠冠状病毒的刺突蛋白在 S1/S2 连接处具有一个功能性的纤连蛋白酶切割位点，其独特的氨基酸序列基序（RDAR）与 SARS-CoV-2 中发现的序列（RRAR）仅相差一个氨基酸。比较结构分析发现，其他蝙蝠乙型冠状病毒在 S1/S2 连接处也具有纤连蛋白酶切割位点，这表明该区域是一个结构上允许切割位点整合的“热点”。我们的研究为蝙蝠冠状病毒的系统发育和功能多样性提供了更广泛的了解，并为可能与跨物种传播潜力相关的特征提供了进化背景。