来自中国稻田土壤的四种具有促植物生长特性的芽孢杆菌属新种

《BMC Microbiology》：Genome-based polyphasic characterization of paddy soil-derived Paenibacillus: proposal of four novel species with plant growth-promoting traits

　　

摘要

背景

芽孢杆菌属（Paenibacillus）主要栖息于与植物相关的生境中，表明其在农业中促进植物生长的潜力。然而，芽孢杆菌属在稻田土壤中的多样性和功能潜力在很大程度上仍未被探索。

结果

本研究从中国稻田土壤中分离出六株菌株，编号为sgz302190、sgz302191、sgz302164^T、sgz302114^T、sgz302115^T和sgz302148^T，并评估了其分类学地位和促植物生长特性。16S rRNA基因序列相似性和系统发育分析表明它们属于芽孢杆菌属（Paenibacillus）。这些菌株的最适生长温度范围为30至37 °C，最适pH为6.0–7.5。所有菌株均含有MK-7作为呼吸醌，正异戊二烯基-C_15:0为主要脂肪酸。所有菌株中主要存在的极性脂质为双磷脂酰甘油、磷脂酰甘油和磷脂酰乙醇胺。这些菌株具有促植物生长特性，包括提高水稻种子萌发率、无机磷酸水解以及产铁载体和吲哚-3-乙酸。它们的平均核苷酸一致性值低于种划分阈值（95–96%）。

结论

根据分析结果，菌株sgz302164^T、sgz302114^T、sgz302115^T和sgz302148^T代表芽孢杆菌属（Paenibacillus）的四个新种，分别命名为Paenibacillus azotofaciens sp. nov.（模式菌株sgz302115^T = MCCC 1K09509^T = GDMCC 1.7245^T = KCTC 43798^T）、Paenibacillus rhodinus sp. nov.（模式菌株sgz302114^T = MCCC 1K09531^T = GDMCC 1.7247^T = KCTC 43796^T）、Paenibacillus caliditolerans sp. nov.（模式菌株sgz302148^T = MCCC 1K09519^T = GDMCC 1.7246^T = KCTC 43799^T）和Paenibacillus phosphatilyticus sp. nov.（模式菌株sgz302164^T = MCCC 1K09510^T = GDMCC 1.7244^T = KCTC 43800^T）。