克服凝胶剂来源的抑制因子，能够在固体培养基上培养严格营养型硝化细菌

《ISME Communications》：Overcoming gelling agent-derived inhibitory factors enables the cultivation of fastidious nitrifiers on solid media

　　

摘要

硝化作用是全球氮循环中的关键过程，然而由于硝化微生物难以培养，对其生理特性的表征仍然有限。尽管非培养依赖方法已提供了重要的生态学见解，但并未完全阐明硝化微生物的生理特性。在此，我们表明常见的凝固剂（琼脂、琼脂糖和结冷胶）中含有对多种硝化微生物以及某些异养细菌具有抑制生长的有毒物质。这些抑制性物质似乎是在高压灭菌过程中产生的，其作用机制与先前报道的过氧化氢不同。通过使用一种简单的洗涤策略去除这些抑制性因子，可以使难以培养的硝化微生物（包括Nitrososphaera，一种氨氧化古菌，以及Nitrospira，一种亚硝酸盐氧化细菌）形成菌落。将该方法应用于环境样本，成功分离出多种难以培养的硝化菌株，包括氨氧化和亚硝酸盐氧化的微生物。综上所述，这些发现表明，硝化微生物在固体培养基上有限的可培养性主要由凝固剂衍生的抑制性物质所致，且可通过一种简单且广泛适用的策略加以克服。