4-氨基喹啉-噻唑烷酮杂合体作为抗原生动物药的设计与合成

《Frontiers in Chemistry》:Design and syntheses of 4-aminoquinoline-thiazolidinone hybrids as anti-protozoal agents

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月07日 来源:Frontiers in Chemistry 5.3

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  摘要:分子杂合(molecular hybridization)是一种有效策略,用于合成可作为双抑制剂(dual inhibitors)的分子,从而应对日益严重的耐药问题;疟原虫(Plasmodium)耐药即为一例。因此,研究人员旨在开发由4-氨基喹啉(4-a

  
摘要:分子杂合(molecular hybridization)是一种有效策略,用于合成可作为双抑制剂(dual inhibitors)的分子,从而应对日益严重的耐药问题;疟原虫(Plasmodium)耐药即为一例。因此,研究人员旨在开发由4-氨基喹啉(4-aminoquinoline,4-AQ)与4-噻唑烷酮(4-thiazolidinone,4-THZ)组成的杂合化合物,先利用分子对接(molecular docking)进行筛选,再进行合成与评价其抗疟潜力。方法中,研究人员依据计算亲和力选择分子,并补充200 ns分子动力学(molecular dynamics,MD)模拟以强化计算机(in silico)对接结果;标题化合物7–18经三步反应合成,包括非极性溶剂加成导致杂环化(heterocyclization),合成后对所有化合物进行表征,并开展体外(in-vitro)、对活性化合物开展体内(in-vivo)评价,同时进行急性毒性研究。结果显示,化合物8、9、14、15、18在Pf-DHFR酶抑制实验中疗效与参比药相当;4个活性化合物在伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)小鼠模型中寄生虫血症抑制率可达84%,平均生存时间达27天;MD模拟表明配体-蛋白复合物在200 ns内稳定;计算机ADMET预测及最活化合物的急性毒性测试未见明显毒性。讨论指出,该类杂合化合物是有前景的抗疟剂,该骨架可作为下一代抗疟药开发的先导结构。
论文解读:《Frontiers in Chemistry》刊发的该项研究聚焦疟原虫耐药背景下抗疟候选分子的开发。疟疾治疗中,喹啉类与青蒿素类药物长期应用,但耐药虫株使可选药物受限;4-氨基喹啉可干扰血红素解毒并抑制二氢叶酸还原酶(dihydrofolate reductase,DHFR),而4-噻唑烷酮类具有化疗增敏(chemo-sensitizing agent,CSA)作用,可逆转耐药。为应对多机制耐药,研究人员采用分子杂合策略,将4-氨基喹啉与4-噻唑烷酮整合,希望获得兼具多靶点活性和克服耐药潜力的抗疟先导物。
关键技术方法上,研究人员从RCSB蛋白数据库获取分辨率与R值达标的靶标晶体结构,用Schr?dinger/Maestro进行蛋白制备,以Glide、诱导拟合对接(Induced Fit Docking,IFD)、量子极化配体对接(Quantum Polarized Ligand Docking,QPLD)筛选并验证;对高亲和配体用GROMACS与CHARMM-36M力场做200 ns分子动力学模拟;用StarDrop、OSIRIS、LAZAR进行ADMET与毒性预测;化学上以4,7-二氯喹啉为起始原料经三步制得7–18;生物评价采用Pf-DHFR体外酶抑制实验,以及以印度国家疟疾研究所提供的P. berghei感染雄性白化小鼠(n=5/组)为模型的Peter四天抑制试验,并依OECD 423做急性毒性评价。
结果与讨论部分保留小标题叙述如下。
2 Materials and methods:研究人员列出计算对接、分子动力学、ADMET预测及化学合成与表征、体外酶抑制、体内四天抑制试验、急性毒性研究的整体方案与公式,不依赖具体试剂罗列而重在方法学框架。
3 Biological activity:研究人员将标题化合物用于Pf-DHFR抑制与P. berghei小鼠模型评价,并以氯喹、蒿甲醚为标准药。
3.1 In vitro study: Pf-DHFR inhibition assay:通过钠醋酸缓冲体系、NADPH与二氢叶酸启动反应,于340 nm监测吸光度变化,研究人员得出化合物8、9、14、15、18抑制活性与参比药相当。
3.2 In vivo study: primary schizonticidal screening (Peter’s four-day suppressive test):研究人员用P. berghei感染小鼠连续四天口服给药,第五天尾静脉涂片和Giemsa染色计数,得出四个活性化合物寄生虫血症抑制率最高84%,平均生存时间最长27天。
3.3 Statistical analysis:研究人员以ANOVA、Dunnett检验等处理数据,判定显著性为P<0.05。
3.4 Acute toxicity study:依OECD 423以5–2000 mg/kg灌胃,研究人员得出最活化合物无主要毒性表现。
4 Results and discussion:研究人员汇总计算与生物结果。
4.1 Computational study: molecular docking:QPLD-XP验证最优;化合物8在Pf-DHFR(PDB 3UM5)中与Tyr267、His268、Leu417及Val273、Pro275、Tyr371、Tyr375形成氢键、π-烷基等相互作用,XP GScore为-9.615;化合物15得分-9.346,亦具强芳香/烷基作用。
4.2 Computational study: molecular dynamics:对化合物8-受体复合物做200 ns模拟。RMSD显示蛋白骨架稳定在约4.2 ?,配体先波动后稳定;RMSF显示吲哚环与氯原子处略有柔性,其余残基平均约2 ?;蛋白-配体接触中Gly44、Thr107、Thr108、Ser111、Ser167参与氢键,Val16、Leu46、Met55等参与疏水作用,Cys50与氯形成卤键,并存在水桥;时间线显示Thr107/108、Ser167持续作用,复合物稳定。
4.3 ADMET prediction:研究人员用StarDrop等预测,化合物均不破Lipinski五规则,具非CNS的静脉/口服可及性与良好人肠吸收(human intestinal absorption,HIA),hERG pIC50在安全范围,多为P-糖蛋白(P-glycoprotein,P-gp)底物;OSIRIS/LAZAR显示高亲和分子无急性、致癌、致突变、生殖毒性和刺激性风险。
讨论部分总结:研究人员认为,4-氨基喹啉-噻唑烷酮杂合体能同时覆盖血红素解毒抑制与DHFR抑制思路,并借4-THZ的CSA属性缓解外排/去烷基化耐药机制;200 ns MD与对接互相印证配体在靶袋稳定,ADMET与急性毒性支持进一步开发。
结论部分原文意译:该研究通过分子杂合得到7–18系列化合物,其中8、9、14、15、18在Pf-DHFR抑制中媲美标准药,部分化合物在P. berghei模型中显著降寄生虫血症并延长生存;计算模拟证明复合物稳定,早期毒理与ADMET未现重大隐患。研究人员得出结论:4-氨基喹啉-4-噻唑烷酮杂合骨架是具前景的抗疟先导(lead),可用于下一代抗疟药开发。
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