《Molecular Plant Pathology》:GmERF109 Positively Enhances Soybean Resistance to Phytophthora sojae by Transcriptionally Activating GmG4DT-Like to Promote Glyceollin I Accumulation
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大豆疫病是由大豆疫霉(Phytophthora sojae)引起的毁灭性病害,对全球大豆(Glycine max)生产构成重大威胁。因此,提高作物对该病原菌的抗性是育种的重要目标。然而,大豆植株响应大豆疫霉侵染的信号机制,以及关键转录因子(Transcript
大豆疫病是由大豆疫霉(Phytophthora sojae)引起的毁灭性病害,对全球大豆(Glycine max)生产构成重大威胁。因此,提高作物对该病原菌的抗性是育种的重要目标。然而,大豆植株响应大豆疫霉侵染的信号机制,以及关键转录因子(Transcription Factor,TF)的调控网络和靶标仍不清楚。研究人员揭示了GmERF109的机制与功能,该基因在大豆抗疫霉Race 1抗感品种间表达不同,编码一个AP2/ERF转录因子。分子评价和抗病分析表明,GmERF109是定位于细胞核的转录因子,正向调控大豆对大豆疫霉的抗性。研究人员还证明GmERF109靶向并激活GmG4DT-like的表达,该基因通过过表达和RNA干扰(RNA interference,RNAi)分析被证实参与植保素glyceollin的生物合成。GmG4DT-like也增强对大豆疫霉的抗性。GmG4DT-like和GmERF109大幅提高glyceollin I异构体含量。总体而言,研究结果表明,GmERF109通过正向调控靶基因GmG4DT-like的表达促进glyceollin积累,从而改善大豆对大豆疫霉的抗性。这些发现为大豆抗大豆疫病机制提供了新见解,并将有助于培育抗病大豆品种。
研究背景方面,大豆疫病由大豆疫霉(Phytophthora sojae)引起,是全球大豆生产的重要威胁。植物通过以转录因子(Transcription Factor,TF)为核心的调控网络应对生物胁迫。AP2/ERF(APETALA2/Ethylene Responsive Factor)转录因子含AP2/ERF结构域,可结合GCC-box调控防御基因。大豆主要植保素(phytoalexin)包括daidzein、genistein和glyceollin I/II/III,其中glyceollin由daidzein前体经苯丙烷途径及异黄酮途径合成,关键酶含苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine Ammonia-Lyase,PAL)、4-香豆酸辅酶A连接酶(4-Coumarate-CoA Ligase,4CL)、查尔酮合酶(Chalcone Synthase,CHS)、异黄酮合酶(Isoflavone Synthase,IFS)以及异戊烯基转移酶4-二甲基烯丙基转移酶(4-Dimethylallyltransferase,G4DT)。已有NAC、MYB、HSF、WRKY等家族调控glyceollin生物合成的研究,但AP2/ERF转录因子是否调控该途径抗大豆疫霉仍不清楚。研究人员此前发现GmAP2为负调控因子,其过表达毛状根转录组中GmERF109显著下调,因此本研究聚焦GmERF109。
主要关键技术方法方面,研究人员以10个大豆品种为材料,其中5个大豆疫霉Race 1感病品种与5个抗病品种来自中国教育部的黑龙江省大豆生物学重点实验室;采用农杆菌(Agrobacterium)介导稳定转化大豆与发根农杆菌(Agrobacterium rhizogenes)介导毛状根转化;通过RNA测序(RNA-seq)鉴定差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEG);利用染色质免疫沉淀定量PCR(Chromatin Immunoprecipitation-qPCR,ChIP-qPCR)验证转录因子与启动子结合;采用本氏烟(Nicotiana benthamiana)双荧光素酶报告系统评估转录激活;以高效液相色谱串联质谱(High-Performance Liquid Chromatography–Tandem Mass Spectrometry,HPLC–MS/MS)定量glyceollin I;并进行体外大豆疫霉抑菌测定。
研究结果如下。2.1 GmERF109 Expression Differs Between Resistant and Susceptible Soybean Cultivars:研究人员对5个感病和5个抗病品种接种大豆疫霉后检测表达,发现感病品种中GmERF109无显著诱导或仅短暂弱诱导,抗病品种中其在12 hpi显著上调约2至8倍,说明该基因可能参与防御。
2.2 GmERF109 Is a Nucleus-Localized TF That Positively Regulates Resistance to P. sojae:研究人员构建GmERF109过表达(OE)与RNA干扰(RNAi)大豆,接种Race 1后,OE株系病斑和病原菌量降低,RNAi相反;亚细胞定位显示GmERF109-GFP在拟南芥原生质体细胞核;酵母GAL4系统证明其具转录激活能力。结论为GmERF109是核定位转录激活因子并正向调控抗性。
2.3 GmERF109 Positively Regulates the Expression of Glyceollin Biosynthesis Genes:研究人员对OE与野生型(Wild Type,WT)根进行RNA-seq,获226个DEG,上调基因富集于黄酮、苯丙烷和trihydroxypterocarpan dimethylallyltransferase活性等过程;RT-qPCR显示GmG4DT-like、GmG4DT、GmCHR6、Gm4CL3、GmCHI1B2、GmCHS7、GmIFS等在OE中升高、RNAi中降低,其中GmG4DT-like变化最显著。
2.4 GmG4DT-like Is a Direct Target of GmERF109:研究人员在候选基因启动子中仅于GmG4DT-like启动子?166 bp处发现GCC-box;ChIP-qPCR显示抗Myc抗体富集该区域;本氏烟双荧光素酶实验中,GmERF109激活野生型启动子,GCC-box突变后激活消失。结论为GmERF109通过GCC-box直接激活GmG4DT-like。
2.5 GmG4DT-like Positively Regulates P. sojae Resistance by Increasing Glyceollin I:研究人员构建GmG4DT-like的OE与RNAi毛状根,接种后OE几乎无病斑、病原菌量减少,RNAi更重;序列比对显示GmG4DT-like与GmG4DT氨基酸一致性82.6%且具NQxxDxxxD和KDxxDxEGD保守催化基序;蛋白定位于核与细胞质;glyceollin I含量在OE中升高、RNAi中降低;体外证实glyceollin I抑制Race 1生长。结论为GmG4DT-like通过促进glyceollin I增强抗性。
2.6 GmERF109 Enhances Resistance to P. sojae by Transcriptionally Activating GmG4DT-Like to Promote Glyceollin I Accumulation:研究人员测定发现GmERF109-OE根中glyceollin I高于WT,RNAi更低;在OE中GmG4DT-like、GmG4DT、GmNAC42-1分别约为WT的23.6、3.0、1.9倍,其他调控基因变化小;抗病品种中GmERF109与GmG4DT-like在12 hpi协同强诱导。结论为GmERF109主要通过强力上调GmG4DT-like促进glyceollin I积累。
讨论部分总结:研究人员指出GmERF109属AP2/ERF家族,在抗病品种被大豆疫霉快速强诱导,定位于核并结合GCC-box,与已知GmERF3等通过PR基因抗病的模式一致。GmG4DT-like具G4DT保守基序并可提高glyceollin I与抗性,证明其为glyceollin I途径新功能基因。已有GmNAC42-1、GmMYB29A2正调,GmWRKY72、GmJAZ1负调;本研究中GmERF109-OE下GmG4DT-like上调远超其他调控因子,说明其代表一条相对独立的AP2/ERF调控分支。该GmERF109–GmG4DT-like模块可解释部分品种间免疫差异,为抗疫霉育种提供新遗传资源。
研究结论部分翻译:综上,研究结果表明,GmERF109是一个关键转录因子,通过直接激活参与植保素glyceollin I生物合成的靶基因GmG4DT-like,增强大豆对大豆疫霉的抗性。该结果确立GmERF109–GmG4DT-like调控途径作为大豆防御分子机制的重要组成部分,为培育抗大豆疫霉大豆品种提供有价值的见解与遗传资源。论文发表于《Molecular Plant Pathology》。