斯里兰卡七个水库尼罗罗非鱼肠道微生物群落比较及环境影响因素研究

《Scientific Reports》：Comparative analysis of the gut microbiota of the wild nile tilapia (Oreochromis niloticus) across the seven reservoirs in Sri Lanka

　　

摘要

尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）是全球具有商业价值的重要淡水鱼种。本研究旨在比较斯里兰卡七个水库中尼罗罗非鱼（O. niloticus）的肠道微生物群落，识别核心微生物群，并考察环境因素对微生物组成的影响。值得注意的是，O. niloticus的肠道微生物群按性别存在显著差异（p ≤ 0.05），并且在Padaviya、Yanoya、Minneriya、Kaudulla、Rathkinda、Ulhitiya和Udawawalawe七个水库中表现出不同的组成。优势细菌属包括Cyanobium、Clostridium sensu stricto 1、Cetobacterium和LD29。Rathkinda和Padaviya水库的肠道微生物丰富度和多样性较高。Paracoccus和Roseomonas属与大多数其他菌属呈负相关，而Romboutsia和Bacillus属与几乎所有其他菌属呈正相关。分离出一系列益生菌，包括Bacillus和Exiguobacterium属的物种，这些菌对水产养殖至关重要。从O. niloticus肠道中分离出一些机会致病菌，如Plesiomonas、Aeromonas、Rothia和Staphylococcus。在研究的水库中，产毒的Cyanobium与多种水质参数呈显著负相关（p ≤ 0.05），包括氯化物、总硬度、钙、总碱度和总溶解固体。我们的结果可以为不同地理位置O. niloticus产业的肠道微生物组组装和可持续发展提供有价值的见解。