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斑点鲮鱼(*Hemibarbus labeo*)染色体水平的基因组组装与注释

《Scientific Data》:Chromosome-level genome assembly and annotation of the spotted steed, Hemibarbus labeo

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月08日 来源:Scientific Data 7.2

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   摘要花斑鲃(Hemibarbus labeo)常被用作评估淡水质量的生物指示物种,同时也是水产养殖业发展的重要物种。为支持其自然资源的保护和可持续利用,亟需高质量的基因组数据以促进种质遗传评估。在本研究中,我们通过整合PacBio测序与Hi-C染色体支架方法,首次获得了H.

  

摘要

花斑鲃(Hemibarbus labeo)常被用作评估淡水质量的生物指示物种,同时也是水产养殖业发展的重要物种。为支持其自然资源的保护和可持续利用,亟需高质量的基因组数据以促进种质遗传评估。在本研究中,我们通过整合PacBio测序与Hi-C染色体支架方法,首次获得了H. labeo的染色体水平基因组组装。最终组装的总大小为1.09 Gb,Contig N50为20.10 Mb。利用Hi-C数据,98.04%的组装Contig被锚定至25条拟染色体上,Scaffold N50达到40.19 Mb。该基因组展现出高度的完整性,BUSCO得分为96.62%。重复序列占组装序列的51.32%,共预测了32,127个蛋白编码基因,其中93.93%具有功能注释。本研究为后续H. labeo种质资源评估及水产养殖业的合理开发提供了坚实的数据支持。

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