《Cell Host & Microbe》：A microbial chromatin remodeler drives gastric cancer progression and immune evasion by reprogramming the host epigenome
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胃癌（GC）一线治疗包括PD-1阻断联合化疗，但耐药问题挑战治疗成效。研究人员识别出咽颊炎链球菌（Streptococcus anginosus，SA）作为一种肿瘤驻留致癌细菌，驱动GC进展与免疫逃逸。SA在GC患者肿瘤中富集并在小鼠中驱动肿瘤生长。SA细胞外
胃癌（GC）一线治疗包括PD-1阻断联合化疗，但耐药问题挑战治疗成效。研究人员识别出咽颊炎链球菌（Streptococcus anginosus，SA）作为一种肿瘤驻留致癌细菌，驱动GC进展与免疫逃逸。SA在GC患者肿瘤中富集并在小鼠中驱动肿瘤生长。SA细胞外囊泡（saEV）将细菌染色质重塑因子saSNF2转运进宿主细胞。saSNF2借助其ATP酶活性并参与BRG1/BRM相关因子（BAF）复合体组装，与宿主转录因子TEAD1合作激活致癌转录。该跨界互作上调锌指DHHC型棕榈酰转移酶ZDHHC11，后者通过棕榈酰化稳定PD-L1，建立免疫抑制微环境，同时放大其他TEAD1靶基因促进肿瘤进展。saEV在体内促进肿瘤生长并减少CD8+ T细胞浸润。药理抑制ZDHHC11可逆转免疫逃逸，并与抗PD-1检查点阻断产生协同。这些发现确立SA为GC的多面驱动因素，并凸显saSNF2-ZDHHC11轴可作为增强免疫治疗的靶点。
研究背景：胃癌（GC）是全球第五大常见恶性肿瘤和第五大癌症死亡原因，慢性幽门螺杆菌（Helicobacter pylori）感染是主要已知风险因素，但仅少数感染者进展为GC，说明存在重要共因子。持久幽门螺杆菌感染会改变胃生理并重塑定植菌群，导致以微生物多样性下降和特定非幽门螺杆菌属富集为特征的菌群失调（dysbiosis）。在新兴细菌共因子中，咽颊炎链球菌（Streptococcus anginosus，SA）是一种口腔共生菌，常在胃病变中检出且丰度随病变进展升高。已有研究证明SA表面蛋白TMPC结合胃黏膜上皮细胞Annexin A2激活MAPK通路，但SA是否及如何调控肿瘤免疫微环境（TIME）以促进免疫逃逸和进展尚不清楚。晚期GC虽采用PD-1阻断联合化疗作为一线方案，但多数患者仍发生原发或获得性耐药，现有PD-L1、微卫星不稳定（MSI）、EB病毒状态等标志物不足以解释耐药机制，因此亟需识别可干预的耐药机制并开发精准免疫治疗。
研究人员开展研究并得出结论：研究人员将SA确立为GC的关键致癌细菌，发现SA释放细胞外囊泡（saEV）把细菌染色质重塑因子saSNF2递送进宿主细胞，saSNF2利用ATP酶功能参与BRG1/BRM相关因子（BAF）复合体组装，并和宿主转录增强因子TEF-1（TEAD1）协作，激活锌指DHHC型棕榈酰转移酶（ZDHHC11）转录；ZDHHC11通过棕榈酰化稳定PD-L1，抑制CD8+ T细胞功能，形成免疫抑制TIME并加速胃癌变。该研究论文发表在《Cell Host 》。
主要关键技术方法：研究人员使用GC患者肿瘤与配邻正常组织样本、139例GC组织芯片（TMA）临床队列、小鼠同源YTN16肿瘤模型、GC细胞系（AGS、MKN-1、MKN-45）及患者来源类器官（PDO）；通过16S rRNA测序分析菌群、RNA测序分析转录改变、saEV分离与DiO标记内化实验、免疫沉淀质谱（IP-MS）与coIP验证蛋白互作、染色质免疫沉淀（ChIP）验证TEAD1占位、酰基生物素交换（ABE）与液相色谱质谱（LC-MS）检测PD-L1棕榈酰化、OT-1 CD8+ T细胞共培养评估免疫功能的实验、凝胶过滤色谱分析BAF复合体组成，以及体内saEV/SA灌胃联合抗PD-1和2-溴棕榈酸（2-BP）治疗实验。
研究结果：
SA is a tumor-resident oncobacterium that drives gastric carcinogenesis：研究人员通过菌属水平LDA分析、患者肿瘤FISH检测、小鼠灌胃SA的皮下YTN16模型、saCM处理GC细胞与PDO，证明SA在GC肿瘤中富集并可促进肿瘤细胞增殖、集落形成、迁移和侵袭；SA灌胃还重塑小鼠肠道微生物组成，说明SA是GC的肿瘤驻留致癌细菌。
saEVs drive tumor progression via dynamin-dependent endocytosis：研究人员超速离心分离saEV，用SEM和NTA表征其50–300 nm形态与粒径，以DiO标记证明GC细胞在2小时内内化saEV；内吞抑制实验显示dynasore而非氯丙嗪或细胞松弛素D阻断摄取，说明saEV经动力蛋白依赖内吞进入细胞，并在体内外促进肿瘤生长与Ki-67、PCNA升高、cleaved caspase-3下降。
saEVs drive GC immune evasion by upregulating the palmitoyltransferase ZDHHC11 to stabilize PD-L1：RNA测序GO分析显示saEV处理细胞富集蛋白棕榈酰化通路，ZDHHC11最显著上调；IP-MS和coIP证明ZDHHC11与PD-L1相互作用，过表达ZDHHC11提升PD-L1蛋白水平并减慢其周转、降低多聚泛素化；体内saEV给药上调ZDHHC11与PD-L1，OT-1共培养中saEV削弱CD8+ T细胞杀伤并抑制IFN-γ、IL-2，确立saEV-ZDHHC11-PD-L1免疫逃逸轴。
saEVs stabilize PD-L1 and potentiate immune evasion via ZDHHC11-mediated palmitoylation at Cys272：LC-MS和ABE实验证明saEV增加PD-L1第272位半胱氨酸棕榈酰化，2-BP可逆转该现象；palmostatin B协同升高PD-L1；ZDHHC11敲低逆转saEV对PD-L1稳定及泛素化抑制；2-BP可恢复CD8+ T细胞杀伤与细胞因子分泌。
The saEV-derived chromatin remodeler saSNF2 enhances TEAD1-mediated transcription of the ZDHHC11 gene：saEV蛋白质组学鉴定出saSNF2，coIP与邻近连接实验（PLA）证明其结合TEAD1；过表达saSNF2不改变TEAD1和PD-L1 mRNA，但增强TEAD1在ZDHHC11启动子占位并上调ZDHHC11，进而提升PD-L1棕榈酰化与免疫逃逸，说明saSNF2是激活TEAD1介导ZDHHC11转录的跨界染色质重塑因子。
The ATPase motif of saSNF2 is critical for TEAD1-mediated transcription and for assembly of the host BAF complex：序列分析发现saSNF2具保守ATP酶基序DXMGLGKT，突变体AAAAAAAA丧失功能；野生型saSNF2增强TEAD1占位、ZDHHC11/PD-L1、PD-L1棕榈酰化及AXL、CTGF、CYR61、SNAI1等TEAD1靶基因，并改变BAF复合体中ARID1A、BAF60A、BAF47分布而不置换BRG1，说明ATP酶基序对TEAD1转录和宿主BAF组装至关重要。
saSNF2 gene expression in tumor cells recapitulates the SA-mediated tumor growth promotion and PD-L1 palmitoylation/stabilization by upregulating ZDHHC11：小鼠过表达saSNF2-WT促进肿瘤体积、重量、Ki-67、PCNA、ZDHHC11、PD-L1并抑制cleaved caspase-3，突变体无此效；139例临床标本中saSNF2在GC组织高表达且预后更差，说明saSNF2具细菌和肿瘤标志物意义。
Pharmacological and genetic targeting of ZDHHC11 synergizes with anti-PD-1 therapy to suppress SA-driven GC by relieving PD-L1-mediated immunosuppression：单细胞测序显示ZDHHC11在上皮/恶性细胞高表达且与CD8+ T细胞浸润负相关；saEV/SA/saSNF2均降低CD8+ T浸润。小鼠中2-BP或抗PD-1单药部分抑瘤，二者联用显著缩小肿瘤、降PD-L1并增CD8+ T浸润；Dox诱导shZdhhc11敲低联合抗PD-1同样协同，说明靶向saSNF2-ZDHHC11-PD-L1轴可用于SA阳性GC。
讨论部分总结：研究人员在讨论中指出，该研究揭示GC中由SA驱动的未知跨界表观遗传调控机制：saEV把细菌染色质重塑因子saSNF2送入宿主细胞核，saSNF2整合进宿主染色质重塑机器并裹挟TEAD1转录程序，同时促肿瘤增殖和免疫抑制微环境。ZDHHC11被saEV激活后可棕榈酰化PD-L1，是GC免疫逃逸新机制；saSNF2与人体BAF催化亚基BRG1同源，通过ATP酶功能增强BAF47、BAF60A、ARID1A与BAF复合体关联，补充宿主BRG1活性以放大致癌转录。研究局限包括saSNF2如何精确整合进宿主BAF复合体及亚基化学计量尚未阐明，靶向SA的抗生素是否带来临床获益仍需前瞻研究。
研究结论部分翻译：该研究揭示GC中由致癌细菌SA驱动的此前未知的跨界表观遗传调控机制。研究人员识别出细菌染色质重塑因子saSNF2经saEV递送至宿主癌细胞。在细胞核内，saSNF2整合进宿主染色质重塑复合体以裹挟转录程序，同时驱动肿瘤增殖并建立免疫抑制微环境。本研究确立SA为GC关键驱动菌，并揭示saSNF2-ZDHHC11-PD-L1轴可作为抵消免疫逃逸的潜在治疗靶点。saEV激活的ZDHHC11是PD-L1的调节因子；saEV来源的saSNF2作为跨界染色质重塑因子调控宿主转录；saSNF2通过其ATP酶活性重塑宿主BAF复合体以放大致癌转录；saSNF2是细菌肿瘤标志物，棕榈酰化抑制联合抗PD-1可作为SA定殖GC的合理疗法。总之，从微生物定殖到免疫逃逸的完整跨界轴为：saSNF2整合进宿主BAF复合体，与TEAD1协作激活致癌和免疫调节转录，并提升ZDHHC11介导的PD-L1棕榈酰化；该工作把肿瘤微生物组从被动伴随者重新定义为疾病的主动表观遗传驱动者，并将saSNF2-ZDHHC11轴定位为增强特定GC亚型免疫治疗的精准医学靶点。
