摘要
背景/目的：基因组再分析可为初次基因检测结果未明确诊断的神经发育障碍（NDDs）患者提供额外的分子诊断。我们评估了伴有或不伴癫痫的NDDs中基因组再分析的诊断阳性率及新确立诊断的机制。方法：我们回顾性审查了2015至2024年间接受全外显子组测序（WES）的175例既往未明确诊断的NDD患者。利用更新的数据库和变异优先级标准对存档的WES变异调用格式（VCF）文件进行重新注释，随后结合表型和遗传方式进行临床解读。患者被分为无癫痫的NDD组（n = 133）和伴癫痫的NDD组（NDD+E；n = 42）。结果：共确立5例新的分子诊断，增量诊断阳性率为3%（5/175）。NDD+E组的阳性率数值上高于NDD组（7% [3/42] vs. 2% [2/133]），但差异无统计学意义（p = 0.090）。新确立的诊断涉及NPRL3、RYR1、SYNGAP1、CSNK2B和SETD5基因，其诊断机制各不相同，包括通过互补CNV检测结合回顾性测序审查、基于表型和遗传方式的重新解读、识别出初次测序覆盖度不足，以及结合新证据进行更新的变异解读等。结论：基因组再评估在既往未明确诊断的儿科NDD病例中提供了额外诊断，虽比例有限但具有临床意义。定期结合表信息对现有基因组数据进行重新评估，并在必要时进行互补检测，可能解决初次评估时遗漏或无法解读的诊断。
