中国江苏地区呼吸道病原体的宏基因组测序分析：一项多中心流行病学研究（2025）

《BMC Infectious Diseases》：Metagenomic sequencing analysis of respiratory pathogens in the Jiangsu region of China: a multicenter epidemiological study (2025)

　　**摘要****背景** 急性呼吸道感染（ARIs）是全球范围内儿童发病和死亡的主要原因之一。靶向宏基因组二代测序（tNGS）能够实现相对无偏且全面的病原体检测。本研究旨在利用临床tNGS平台，刻画中国江苏省呼吸道病原体检测的流行病学特征。**方法** 2025年1月至12月间，共收集来自江苏省13个地区的急性呼吸道感患者28,736份呼吸道标本，采用tNGS进行分析。所有检出的微生物分为四类：细菌、病毒、非典型病原体和病原菌。根据年龄、地理区域、季节及感染模式（单一感染与混合感染）进行分层分析。采用卡方检验评估各层间检出率的差异，双侧*p* < 0.05被认为具有统计学意义。**结果** 28,736份标本中至少检出一种呼吸道微生物（100%）；然而，这一结果反映了tNGS的高分析灵敏度，并不一定意味着每个病例都具有临床意义的感染。细菌检出率最高，为72.4%，其次为病毒（66.6%）、非典型病原体（6.3%）和其他病原体（3.2%）。混合感染占标本的68.7%，在1~4岁儿童中检出率最高（73.5%），在≥60岁人群中最低（46.2%）。前五种优势病原体分别为流感嗜血杆菌（26.4%）、肺炎链球菌（23.0%）、卡他莫拉菌（21.1%）、金黄色葡萄球菌（18.4%）和鲍曼不动杆菌（13.1%）。在不同年龄组（χ2 = 412.7，*p* < 0.001）、地理区域（χ2 = 189.3，*p* < 0.001）和季节（χ2 = 48.2，*p* < 0.001）间的病原体检出分布存在具有统计学意义的差异。最常见的混合感染组合为流感嗜血杆菌联合肺炎链球菌。**结论** 本研究作为大规模tNGS研究，揭示了华东地区呼吸道微生物检出呈现的复杂谱系，其特征为混合感染高发以及显著的年龄、地区和季节差异。这些发现提供了流行病学背景，可为临床诊断策略和区域公共卫生干预提供参考，但需结合定植和选择偏倚进行谨慎解读。