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整合网络毒理学与计算分析预测邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)在银屑病中的多靶点作用机制
《Toxicology and Environmental Health Sciences》:Integrated network toxicology and computational analysis predicts the multi-target mechanism of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) in psoriasis
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月09日 来源:Toxicology and Environmental Health Sciences 2.0
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摘要目的本研究采用结合网络毒理学、生物信息学和计算模拟的综合方法,探讨邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)与银屑病之间的潜在关联。方法我们从公共数据库中鉴定了DEHP与银屑病的共享靶点,并分析GSE13355数据集中的差异表达基因以获得DEHP诱导银屑病的潜在靶点。使用
本研究采用结合网络毒理学、生物信息学和计算模拟的综合方法,探讨邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)与银屑病之间的潜在关联。
我们从公共数据库中鉴定了DEHP与银屑病的共享靶点,并分析GSE13355数据集中的差异表达基因以获得DEHP诱导银屑病的潜在靶点。使用机器学习算法(LASSO和随机森林)筛选核心基因,并在GSE226244数据集中进行验证。随后进行富集分析、免疫浸润评估、分子对接和分子动力学(MD)模拟,以探索潜在机制及结合稳定性。
共鉴定出453个共享靶点,通过差异表达分析获得34个潜在靶点。筛选出六个核心基因——AKR1B10、S100A9、TGM1、CLEC7A、CXCR2和CCR7,这些基因在银屑病皮损中显著上调,具有较高的诊断价值(交叉验证AUC > 0.951)。富集分析显示这些基因与病毒蛋白–细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路、角质包膜形成以及细胞因子–细胞因子受体相互作用等通路相关。免疫浸润分析表明其与中性粒细胞及活化的CD4+ T细胞呈中度相关。分子对接显示DEHP与AKR1B10具有中等结合亲和力(? 8.7 kcal/mol),分子动力学模拟表明该复合物在模拟条件下结合相对稳定(RMSD、Rg、RMSF和SASA值一致)。
这些计算结果提示DEHP可能通过多靶点、多通路机制影响银屑病。然而,仍需实验及流行病学验证以证实这些预测。
本研究采用结合网络毒理学、生物信息学和计算模拟的综合方法,探讨邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)与银屑病之间的潜在关联。
我们从公共数据库中鉴定了DEHP与银屑病的共享靶点,并分析GSE13355数据集中的差异表达基因以获得DEHP诱导银屑病的潜在靶点。使用机器学习算法(LASSO和随机森林)筛选核心基因,并在GSE226244数据集中进行验证。随后进行富集分析、免疫浸润评估、分子对接和分子动力学(MD)模拟,以探索潜在机制及结合稳定性。
共鉴定出453个共享靶点,通过差异表达分析获得34个潜在靶点。筛选出六个核心基因——AKR1B10、S100A9、TGM1、CLEC7A、CXCR2和CCR7,这些基因在银屑病皮损中显著上调,具有较高的诊断价值(交叉验证AUC > 0.951)。富集分析显示这些基因与病毒蛋白–细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路、角质包膜形成以及细胞因子–细胞因子受体相互作用等通路相关。免疫浸润分析表明其与中性粒细胞及活化的CD4+ T细胞呈中度相关。分子对接显示DEHP与AKR1B10具有中等结合亲和力(? 8.7 kcal/mol),分子动力学模拟表明该复合物在模拟条件下结合相对稳定(RMSD、Rg、RMSF和SASA值一致)。
这些计算结果提示DEHP可能通过多靶点、多通路机制影响银屑病。然而,仍需实验及流行病学验证以证实这些预测。