媒介身份塑造匹配家周栖息地中蚊子和咬人蠓的病毒组结构

《Parasites & Vectors》：Vector identity structures mosquito and biting midge viromes in matched peridomestic habitats

　　

摘要

背景

蚊类和库蠓（Culicoides）是最重要的吸血双翅目昆虫，在媒介传播病毒的生态中扮演关键角色。尽管这两类媒介生物在人居周边环境中经常共同出现，但在匹配的生态条件下对其病毒组的系统比较却很少开展。

方法

2017至2019年间，我们从中国江西省和海南省采集了26个蚊类和库蠓混合样本池，并进行了宏转录组测序。这些样本池被组织为13组栖息地匹配的蚊—蠓配对，来源包括鸡舍、牛棚、犬舍、猪圈、羊圈和人类住所。

结果

基于这些数据，我们鉴定了659种病毒物种，包括623种RNA病毒和36种DNA病毒，涵盖15个RNA病毒超群和4个DNA病毒科。其中大部分为推定新物种，包括522种RNA病毒和34种DNA病毒。在应用RPM > 100的阈值筛选后，保留了285种病毒物种，其中包括230种仅见于库蠓的病毒、49种仅见于蚊类的病毒，仅有6种共享病毒。尽管两类媒介的总体病毒载量之间无显著差异，但病毒组组成表现出强烈的媒介相关性分离，而与脊椎动物宿主相关的栖息环境无显著影响。虫媒病毒相关序列也呈现媒介相关模式：日本脑炎病毒（JEV）和格塔病毒（GETV）在蚊类中检测到，而芒什病毒（MSV）、小野病毒（OYAV）和西藏环病毒（TIBOV）则在库蠓中检测到。随着媒介系统发育距离的减小，病毒共享程度增加，表明媒介间的亲缘关系有助于病毒组的重叠。

结论

总之，人居周边环境中匹配采样表明，媒介分类群（而非脊椎动物宿主相关的栖息环境）是共同出现的蚊类和库蠓中总病毒组及媒介传播病毒组组成的主要关联因素。这些发现支持将库蠓作为病毒组研究中一个独立且采样不足的研究对象进行进一步监测。