中国三座城市禽类暴露环境及不明原因肺炎住院患者的禽流感病毒多环节监测

《Virology Journal》：Multi-section surveillance of AIVs in poultry exposure environments and hospitalized PUE in three Chinese cities

　　

摘要

背景

禽流感病毒（AIVs）的全球扩散，尤其是2.3.4.4b H5系病毒，继续构成严重的人畜共患病威胁。尽管中国的疫苗接种加扑杀策略已降低了H5和H7暴露相关的疾病活动，但病毒的持续进化和重配突显了在人-环境界面进行持续监测的必要性。

方法

2021年12月至2023年12月，在中国三个城市采集了来自活禽市场（LPMs）、屠宰场和家禽养殖场/农家院落的环境样本，以及不明原因肺炎（PUE）住院患者的呼吸道标本。采用实时逆转录聚合酶链反应（rRT-PCR）检测甲型流感病毒（IAV）及H5、H7、H9和H10亚型。使用卡方检验比较各城市和采样点的阳性率。使用克鲁斯卡尔-瓦利斯检验比较各环境样本类别间的月度阳性率，使用双侧威尔科克森符号秩检验比较2022年与2023年间的配对月度阳性率。对H5、H9和H10病毒进行HA基因测序和系统发育分析。

结果

在8,335份环境样本中，甲型流感病毒总体阳性率为32.2%；H9占主导地位（20.1%），其次为H5（7.1%），H10散发（0.2%），未检测到H7。秋季和冬季H5和H9阳性率较高。2023年H5和H9的中位月度阳性率低于2022年，但差异无统计学意义。活禽市场和屠宰场的H5和H9阳性率通常高于养殖场/农家院落。在各环境样本类别中，H5差异无统计学意义（P?=?0.06），而H9差异有统计学意义（P?=?0.03），其中案板和血污水的中位阳性率高于饮用水。系统发育分析显示，所有H5、H9和H10病毒均属于欧亚谱系，H5病毒聚集在2.3.4.4b系中。数个环境H9病毒与代表性人源H9N2病毒关系密切。在840份PUE呼吸道标本中，86份季节性流感病毒检测阳性，但未检测到H5、H7、H9或H10。

结论

多种禽流感病毒亚型在家禽暴露环境中持续循环。需持续开展整合家禽暴露环境和人群的跨领域同一健康监测，以追踪禽流感病毒的进化和人畜共患风险。