《Journal of Infection and Public Health》：Distribution of fungal isolates recovered from clinical specimens in Saudi Arabia: A four-year retrospective study
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背景：真菌感染是日益严重的临床问题，尤其在免疫功能低下患者中更为突出。沙特阿拉伯本地关于真菌分离株的数据仍然有限。本研究描述了某三级医疗中心临床标本中主要真菌类群的年度分布及真菌分离株的总体种级分布。方法：研究人员对2021年至2024年沙特阿拉伯利雅得一家中
背景：真菌感染是日益严重的临床问题，尤其在免疫功能低下患者中更为突出。沙特阿拉伯本地关于真菌分离株的数据仍然有限。本研究描述了某三级医疗中心临床标本中主要真菌类群的年度分布及真菌分离株的总体种级分布。方法：研究人员对2021年至2024年沙特阿拉伯利雅得一家中心真菌学实验室接收的临床标本进行回顾性分析。血培养分离株被排除，因为其遵循单独诊断流程，仅在结果阳性后送交真菌学实验室。分离株采用常规方法与基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）鉴定。按主要真菌类群（念珠菌属、丝状真菌、非念珠菌酵母及酵母样真菌）评估年度分布，属级与种级分布以研究期内累计总数报告。结果：在7443份处理标本中，1658份（22%）有真菌生长。念珠菌属为最常见分离株（64.3%），其次为丝状真菌（27.1%），再次为非念珠菌酵母及酵母样真菌（8.6%）。主要念珠菌为白色念珠菌（Candida albicans，39.7%）、光滑奈瑟酵母（Nakaseomyces glabratus，原念珠菌 glabrata，14.7%）、都柏林念珠菌（Candida dubliniensis，12.5%）、热带念珠菌（Candida tropicalis，10.0%）、近平滑念珠菌（Candida parapsilosis，9.7%）和耳念珠菌（Candidozyma auris，原念珠菌 auris，5.8%）。丝状真菌中曲霉属（Aspergillus spp.）占比最大（43.9%），其次为皮肤癣菌（37.4%）；优势种为黄曲霉（A. flavus，18.9%）、黑曲霉（A. niger，16.5%）、犬小孢子菌（Microsporum canis，25.8%）和须毛癣菌/趾间毛癣菌复合群（Trichophyton mentagrophytes/interdigitale complex，7.8%）。分离株分布因标本类型而异，≥65岁患者回收数最高。结论：这项四年研究描述了沙特医疗环境中真菌分离株分布。念珠菌属为总体最主要真菌分离株，白色念珠菌为最常见种；曲霉属为最主要丝状真菌类群。
研究背景方面，真菌感染（mycoses）已成为全球重大公共卫生问题，在免疫功能低下、危重症、老年及合并慢性阻塞性疾病、糖尿病、结核等基础疾病人群中危害尤为突出。尽管全球真菌病影响超十亿人并致每年逾170万死亡，真菌病原仍较结核、疟疾等被明显低估。2022年世界卫生组织（WHO）发布真菌优先病原体清单，将白色念珠菌、耳念珠菌、烟曲霉（Aspergillus fumigatus）和新型隐球菌（Cryptococcus neoformans）列为危急级。沙特阿拉伯已有研究多聚焦单一病原或单类标本，缺少从中心真菌学实验室出发、跨多类临床标本的综合分布数据，因此难以支撑本地耐药监测、临床预警与经验性诊治策略。研究人员正是在这一背景下，利用利雅得King Abdulaziz Medical City–Riyadh（KAMC-R）中心真菌学实验室数据，开展2021—2024年临床标本真菌分离株分布描述研究，论文发表于《Journal of Infection and Public Health》。
关键技术方法方面，研究人员采用回顾性实验室研究设计，数据来自KAMC-R微生物实验室信息系统与BestCare人口学系统；标本分为侵入性、呼吸道、浅表、泌尿生殖及其他类，血液标本除外；为减少重复计数，同一患者同菌种21天内仅计1株；真菌经10%氢氧化钾（KOH）镜检、沙保弱葡萄糖（SAB）琼脂及皮肤癣菌选择培养基培养，酵母与丝状真菌用MALDI-TOF MS（基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱）和/或形态学鉴定；分析以主要真菌类群年度分布和全期属种累计分布为主，不开展分子确认与药敏试验。
研究结果方面，整体样本特征显示，7443份标本中1658份阳性，2023、2024年阳性绝对数上升但总阳性率约20%—25%。人口学特征显示阳性者男性略多，平均年龄46±21岁，≥65岁组最多占29.1%。主要真菌类群分布中，念珠菌属占64.3%，丝状真菌27.1%，非念珠菌酵母及酵母样真菌8.6%；年度分布表明念珠菌属占比由2021年58.8%升至2024年67.4%，非念珠菌酵母及酵母样真菌由16.5%降至约5%。念珠菌物种分布与标本类型研究显示，念珠菌属最常自呼吸道回收（53.8%），BAL（支气管肺泡灌洗液）占28.7%；白色念珠菌占39.7%，非白色念珠菌合计60.3%，其中光滑奈瑟酵母14.7%、都柏林念珠菌12.5%；耳念珠菌占5.8%，提示重点病原已在本地出现。丝状真菌分离株分布与特征研究显示，71.5%来自浅表标本，指甲屑占30.5%；曲霉属占丝状真菌43.9%，黄曲霉18.9%、黑曲霉16.5%；皮肤癣菌占37.4%，犬小孢子菌25.8%为最多；暗色真菌、其他透明非皮肤癣菌霉、毛霉目（Mucorales）占比较低。非念珠菌酵母及酵母样真菌研究显示，55.2%来自呼吸道，痰占39.2%；马拉色菌属（Malassezia spp.）占10.5%，酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）6.3%，其他未细分非念珠菌酵母占65.7%，多提示气道定植或环境来源。
讨论部分总结，研究人员指出呼吸道念珠菌和曲霉更多反映定植或环境暴露，无菌部位回收更具临床意义；都柏林念珠菌占比较高与MALDI-TOF MS提升近缘种分辨力有关；耳念珠菌检出符合区域与全球多重耐药病原流行趋势；黄曲霉在沙特及中东占优与气候和环境暴露一致；皮肤癣菌局限角质组织，马拉色菌关联皮脂丰富区浅表感染。研究局限包括无详细临床表型、无分子确认、排除血培养故不能代表念珠菌血症、未做药敏。
结论部分翻译如下：本研究概述了三年内三大主要真菌类群年度分布及四年多类临床标本种级分布。念珠菌属为主要真菌类群，尤见于呼吸道与侵入性标本；丝状真菌多见于浅表标本，以曲霉属和皮肤癣菌为主；非念珠菌酵母及酵母样真菌占比最小，主要见于呼吸道与浅表标本。这些发现有助于理解沙特阿拉伯本地真菌分离株分布，并凸显对非无菌标本（如呼吸道标本）中实验室报告真菌分离株需谨慎判读，因定植十分常见。
