《Brain Pathology》：Molecular profiling of pediatric medulloblastoma in Kazakhstan: Genomic alterations, subgroup distribution, and survival
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髓母细胞瘤是最常见的儿童恶性脑肿瘤，包含生物学上不同的分子亚组，这些亚组具有不同的临床病理学和预后特征。来自哈萨克斯坦和其他代表性不足地区的分子数据仍然有限，并且在无法常规开展高级分子分类的环境中，需要利用福尔马林固定石蜡包埋（formalin-fixed,
髓母细胞瘤是最常见的儿童恶性脑肿瘤，包含生物学上不同的分子亚组，这些亚组具有不同的临床病理学和预后特征。来自哈萨克斯坦和其他代表性不足地区的分子数据仍然有限，并且在无法常规开展高级分子分类的环境中，需要利用福尔马林固定石蜡包埋（formalin-fixed, paraffin-embedded, FFPE）材料进行分子亚组分配的实用方法。研究人员回顾性分析了2015年至2024年间在哈萨克斯坦“大学医学中心”企业基金会（Corporate Fund “University Medical Center”）诊断的40例儿童髓母细胞瘤。对存档的FFPE肿瘤材料进行了组织学复查、免疫组织化学评估（β-catenin、YAP1和GAB1）以及全外显子测序。采用形态学、免疫表型和基因组相结合的综合框架将肿瘤分配至WNT、SHH或non-WNT/non-SHH类别，并评估了各亚组的临床病理学变量和总生存期。WNT髓母细胞瘤（n=7，17.5%）显示出最典型的特征，表现为经典型组织学、均匀的β-catenin核阳性、复发性CTNNB1/APC改变以及频繁的6号染色体缺失。SHH髓母细胞瘤（n=10，25.0%）富集促结缔组织增生/结节型形态、频繁的YAP1/GAB1表达、致病性PTCH1/SUFU改变，以及部分病例中涉及TP53、TERT和局灶性扩增的额外事件。non-WNT/non-SHH髓母细胞瘤（n=23，57.5%）显示出最大的基因组异质性，包括频繁的i17q和更广泛的结构复杂性。临床上，WNT肿瘤主要发生于年龄较大的儿童，且生存期最有利，而non-WNT/non-SHH肿瘤是唯一与就诊时转移性疾病相关的亚组，且长期生存最差。总体而言，该队列中的儿童髓母细胞瘤表现出与既定生物学一致的亚组特异性模式。病理学、免疫组织化学和测序的整合实现了具有临床意义的分子分层。这些发现扩展了来自代表性不足地区的证据，并支持在日常实践中采用务实且适应资源的分子分型方法。
**论文解读：哈萨克斯坦儿童髓母细胞瘤的整合分子分型与临床意义**
髓母细胞瘤（medulloblastoma，MB）是儿童最常见的恶性脑肿瘤，约占儿童脑肿瘤的20%，多发生于后颅窝，具有高度侵袭性和脑脊液播散倾向。当前世界卫生组织（WHO）分类将MB分为WNT激活型、Sonic hedgehog（SHH）激活型（进一步细分为TP53野生型与突变型）以及non-WNT/non-SHH型（涵盖既往的Group 3和Group 4）。这些分子亚组在发病年龄、驱动变异、拷贝数谱、转移行为及预后方面存在显著差异，是现代风险分层和治疗决策的核心依据。然而，DNA甲基化谱分析作为分子分类的参考标准，因成本高昂、基础设施要求高及生物信息学分析复杂，在许多医疗中心难以普及。哈萨克斯坦此前缺乏儿童MB的综合分子数据，仅有针对TP53和CTNNB1的靶向研究或临床病理描述。因此，利用常规可获取的福尔马林固定石蜡包埋（formalin-fixed, paraffin-embedded，FFPE）材料，建立整合性分子分型工作流程，对于资源有限地区具有重要的现实意义。
该研究于2025年发表在《Brain Pathology》，由哈萨克斯坦“大学医学中心”企业基金会联合多家机构完成。研究人员回顾性收集了2015年至2024年间在该中心诊治的40例儿童MB病例，所有患者均按照哈萨克斯坦国家治疗方案（基于HIT 2000和HIT-REZ 2005策略）接受外科手术、放疗和化疗。研究综合运用组织病理学、免疫组织化学（检测β-catenin、YAP1、GAB1）、全外显子测序（whole-exome sequencing，WES）和拷贝数变异（copy-number alterations，CNAs）分析，将肿瘤分配至WNT、SHH或non-WNT/non-SHH类别，并比较各亚组的临床病理特征和总生存期（overall survival，OS）。由于未进行DNA甲基化分析，研究未进一步区分Group 3与Group 4，而是将无典型WNT/SHH特征的肿瘤统一归入non-WNT/non-SHH类。
**主要技术方法**：研究队列为40例来自哈萨克斯坦“大学医学中心”的儿童MB存档FFPE标本。关键方法包括：组织学复查（苏木精-伊红染色和银浸染）、免疫组织化学（β-catenin、YAP1、GAB1）、全外显子测序（WES）及基于WES的拷贝数变异分析；部分单核苷酸变异通过Sanger测序验证，部分拷贝数改变通过多重连接依赖探针扩增（MLPA）验证。统计采用卡方检验、Fisher精确检验及Kaplan-Meier生存分析。
**研究结果**
**3.1 队列特征**：40例患者中位诊断年龄8.0岁（范围0.5–16.0岁），男性占70.0%，中位随访63个月。就诊时T3b期最常见（33.3%），20.5%的患者存在转移；全切（S1）占35.9%，可见残留肿瘤（R3）占43.6%。
**3.2 综合分子分类**：依据整合框架，肿瘤被分配为WNT型（7例，17.5%）、SHH型（10例，25.0%）和non-WNT/non-SHH型（23例，57.5%），后者占比最大。
**3.3 组织病理学与免疫组织化学特征**：WNT型全部为经典型组织学，β-catenin核阳性率100%，YAP1阳性5/7，GAB1全部阴性。SHH型中60%呈促结缔组织增生/结节型形态，YAP1阳性率80%，GAB1阳性率仅20%。non-WNT/non-SHH型以经典型为主（78.3%），另有21.7%为大细胞/间变型，缺乏WNT/SHH相关的典型免疫表型。这些发现通过组织学和免疫组化直接支持了分子分类。
**3.4 各分子亚组的临床病理特征**：年龄分布差异有统计学意义（p=0.008），WNT型85.7%见于10岁以上儿童，SHH型年龄分布较宽，non-WNT/non-SHH型集中于3–10岁。转移仅出现在non-WNT/non-SHH型（36.4%），WNT和SHH型无转移（p=0.020）。WNT型全切率较高（57.1%），但手术与影像残留差异未达显著。
**3.5 基因组景观**
**3.5.1 复发性遗传改变**：WNT型中4/7检出CTNNB1（3例）或APC（1例）致病性变异，并伴有SMARCA4、KMT2D、DDX3X等继发事件。SHH型中4/10检出PTCH1（2例）或SUFU（2例）致病性变异，另有TP53突变（2例）、TERT启动子变异（2例）、MYCN扩增（3例）等。non-WNT/non-SHH型缺乏统一驱动，可见MBD4（3例）、SON（2例）、CHEK2、PMS2等变异。
**3.5.2 拷贝数变异模式**：WNT型以6号染色体缺失为主（6/7）。SHH型常见9q缺失（5例）、1q获得（3例）、10q缺失（3例）及i17q（4例）。non-WNT/non-SHH型拷贝数结构最为复杂，i17q出现于13/23例，其他包括8号染色体缺失、7号染色体获得等。
**3.6 生存与结局分析**：WNT型无死亡，3年和5年OS均为100%。SHH型死亡3/10，中位OS为151.0个月，3/5年OS为90.0%。non-WNT/non-SHH型死亡11/23，中位OS为131.0个月，3/5年OS为85.6%。整体log-rank检验未显示显著差异（p=0.151），但Peto-Peto检验提示亚组间生存差异存在边际意义（p=0.045）。总体预后梯度为WNT最佳、SHH居中、non-WNT/non-SHH最差。
**讨论总结与结论**：该研究首次在哈萨克斯坦儿童MB中展示了基于FFPE的整合分子分型可行性。观察到的亚组分布、临床病理关联和基因组特征与既往国际队列一致，支持该方法的有效性。然而，并非所有WNT或SHH肿瘤均检出典型通路驱动变异，提示分子分型需要整合多维度证据。GAB1在SHH型中敏感性低，不宜单独作为分型标志。两例TP53突变的SHH型患者生存时间较长，但样本量小，无法得出确定性结论。研究局限性包括单中心小样本、缺乏甲基化分类及肿瘤-only测序的固有局限。结论认为，结合组织学、免疫组化、WES和拷贝数分析的FFPE适用工作流程，可在资源有限环境下提供具有临床意义的MB分子分层，并为哈萨克斯坦及其他代表性不足地区开展更大规模、基于甲基化的研究奠定基础。
