纤细罗什妮氏菌182株（克里斯滕森菌科一种新型人体肠道分离菌）的整合基因组与功能表征

《BMC Microbiology》：Integrated genomic and functional characterization of Luoshenia tenuis strain 182, a novel human gut isolate of the family Christensenellaceae

　　

摘要

背景

Christensenellaceae 科成员日益与宿主代谢健康相关联，其中包含最近描述但表征较少的 Luoshenia（罗氏菌属）。本研究对从健康粪便供体中分离出的一种新型人体肠道共生菌 Luoshenia tenuis 182 菌株进行了基因组和功能性表征。为研究其生态适应性及与宿主上皮细胞的相互作用，我们将 计算机基因组分析与 体外功能实验相结合。

结果

基因组分析揭示 Christensenellaceae 科具有开放的泛基因组以及在数据集范围内的显著遗传可塑性。泛基因组分析与比较基因组分析的综合结果鉴定出 106 个 182 菌株独有的基因，突出了潜在的菌株特异性功能适应。该菌株对多种临床相关抗生素敏感，且缺乏关键毒力因子，表明其致病潜力低。182 菌株展现出支持肠道存活的适应性特征，包括对胆盐的高度耐受性、短暂氧气暴露后的生长能力以及形成孢子的证据。L. tenuis 182 菌株的 体外宿主-微生物相互作用显示出共生活性，该菌株未诱发肠道上皮细胞的促炎反应，未破坏上皮屏障完整性，并表现出对上皮细胞和黏液的黏附能力。这是首个研究 Luoshenia 属上皮相互作用的研究，也是首次利用泛基因组分析将 Luoshenia 属与 Christensenellaceae 科基因组进行比较。虽然未观察到抗炎效应，但 体外功能分析揭示该菌株具有结合胆固醇的能力，并有可能降低 Caco-2 细胞对胆固醇的吸收。

结论

总之，L. tenuis 182 菌株表现出肠道环境适应能力和菌株特异性代谢特征。该菌株可被认为具有良好安全性特征。本研究的结果为进一步研究 182 菌株在肠道脂质代谢中的潜在作用及其可能的治疗应用奠定了基础。