基于T2加权磁共振成像的三种儿童后颅窝肿瘤自动分割、分类及分子亚型分型的深度学习流程

《JOURNAL OF MAGNETIC RESONANCE IMAGING》:Deep Learning Pipeline for Automatic Segmentation, Classification, and Molecular Subtyping of Three Pediatric Posterior Fossa Tumors Using T2-Weighted MRI

【字体: 时间:2026年09月09日 来源:JOURNAL OF MAGNETIC RESONANCE IMAGING 4.3

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   摘要 背景 儿童后颅窝肿瘤在不同肿瘤类型和分子亚型之间在恶性程度、治疗方法和预后

  

摘要

背景

儿童后颅窝肿瘤在不同肿瘤类型和分子亚型之间在恶性程度、治疗方法和预后方面存在差异,但无创术前鉴别仍然具有挑战性。

目的

开发一个基于深度学习(DL)的流程,使用T2加权(T2w)磁共振图像自动分割儿童后颅窝肿瘤,区分肿瘤类型(髓母细胞瘤[MB]、室管膜瘤[EP]、毛细胞星形细胞瘤[PA]),并分类MB和EP的分子亚型。

研究类型

回顾性和前瞻性。

人群

来自三个中心的1305例患者(男/女:828/477;490例MB,327例EP,488例PA)。对于肿瘤分割和分类,在训练集(n=880)上开发PF-nnU-Net,并在验证集(n=220)、内部前瞻性测试集(n=90)以及两个外部独立测试集(n=68,n=47)上进行验证。MB-nnU-Net在338例患者上训练,并在63例患者上测试MB亚型分类;先前开发的EP-nnU-Net在38例患者上测试EP亚型分类。

场强/序列

1.5T或3T磁共振成像,轴位T2w图像(快速自旋回波)。

评估

三种基于nnU-Net的模型:PF-nnU-Net和MB-nnU-Net用于开发,EP-nnU-Net用于验证。在训练集上进行了五折交叉验证,随后在独立测试集上进行测试。

统计检验

分割使用Dice相似度系数。分类使用准确率、灵敏度、特异度、受试者工作特征曲线下面积(AUC)和Cohen's kappa。双侧p<0.05被认为具有显著性。

结果

PF-nnU-Net的Dice得分达到0.94–0.96,总体分类准确率为0.824–0.918(多分类Cohen's kappa:0.722–0.873)。MB-nnU-Net的总体准确率为0.794(多分类Cohen's kappa:0.605),EP-nnU-Net的准确率为0.789(Cohen's kappa:0.538)。

数据结论

开发并验证了一个全自动深度学习流程,可准确分割儿童后颅窝肿瘤,区分肿瘤类型(MB、EP、PA),并分类MB和EP的分子亚型。

证据水平

3级。

技术效能

第2阶段。

简明摘要

儿童后颅窝肿瘤在严重程度和治疗方面存在差异。准确的肿瘤分型和分子亚型分类有助于指导治疗,但无创术前诊断仍然具有挑战性。本研究开发了一个基于深度学习(DL)的流程,使用T2加权(T2w)磁共振图像自动分割儿童后颅窝肿瘤,区分肿瘤类型(髓母细胞瘤[MB]、室管膜瘤[EP]、毛细胞星形细胞瘤[PA]),并分类MB和EP的分子亚型。该流程在多中心数据中展现了稳健的分割能力和高的分类准确率,并可靠地区分了MB和EP的分子亚型。这些发现表明,该流程可能作为一种无创工具来辅助临床诊断。

利益冲突

作者声明不存在利益冲突。

数据可用性声明

由于患者隐私保护的合规性限制,本研究中产生的数据不公开提供。然而,在合理请求并同意数据传输协议的情况下,通讯作者可向合格研究人员提供数据。代码可在以下地址获取:https://github.com/zrllk/v1

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