重症病毒性肺炎的肺部微生物组分析及预后标志物筛选

《Scientific Reports》：Pulmonary microbiome analysis and screening of prognostic markers in severe viral pneumonia

　　

摘要

旨在利用宏基因组下一代测序（mNGS）技术调查重症病毒性肺炎患者肺部微生物组与 90 天死亡率之间的关联。采用 Cox 比例风险回归和 LASSO 回归识别与预后相关的变量。采用 2023 年 6 月至 2025 年 2 月间接受 mNGS 检测的 56 例重症肺炎患者外部队列，评估肺部微生物多样性与临床结局之间关联的可重复性。我们回顾性纳入 2022 年 6 月至 2023 年 9 月间入住重症监护室（ICU）的 87 例重症病毒性肺炎患者。主要结局为 90 天全因死亡率。比较生存组（n = 23）与死亡组（n = 64）之间肺部微生物组成和差异。与死亡组相比，生存组表现出显著更高的肺部微生物α多样性，包括香农指数（P = 0.032）和基尼 - 辛普森指数（P = 0.012）。基础疾病与肺部微生物多样性无显著关联。纳入基尼 - 辛普森指数的预后模型的判别能力高于仅基于常规临床变量的模型（AUC：0.863 对比 0.799）。在外部队列中也观察到肺部微生物多样性与临床结局之间的类似关联。重症病毒性肺炎生存患者表现出更大的肺部微生物α多样性及更高丰度的口腔共生菌，而肠杆菌科在死亡组中检测到的频率更高。肺部微生物多样性可能为评估重症病毒性肺炎患者的 90 天死亡率提供额外的预后信息。