肺癌中的促炎与自噬通路:关键基因ADINR、C/EBPα、CHAST、ATG5、IL-1B及DICER1-AS1的失调

《Biochemistry and Biophysics Reports》:Pro-inflammatory and autophagic pathways in lung cancer: dysregulation of key genes ADINR, C/EBPα, CHAST, ATG5, IL-1B, and DICER1-AS1

【字体: 时间:2026年09月09日 来源:Biochemistry and Biophysics Reports 3.3

编辑推荐:

  目的:肺癌在男女中的发病率均居第二位,并且仍然是癌症相关死亡的主要原因。本研究旨在评估肺癌组织中选定的活化B细胞核因子κB轻链增强子(NF-κB)信号通路相关基因和长链非编码RNA(lncRNAs)的表达谱,特别是参与促炎和自噬通路的基因与lncRNAs。方法

  
目的:肺癌在男女中的发病率均居第二位,并且仍然是癌症相关死亡的主要原因。本研究旨在评估肺癌组织中选定的活化B细胞核因子κB轻链增强子(NF-κB)信号通路相关基因和长链非编码RNA(lncRNAs)的表达谱,特别是参与促炎和自噬通路的基因与lncRNAs。方法:研究人员评估了该通路中三个NF-κB相关mRNA编码基因(CCAAT/增强子结合蛋白α(C/EBPα)、自噬蛋白5(ATG5)和白细胞介素-1b(IL-1B))以及六个lncRNAs(INK4基因座反义非编码RNA(ANRIL)、脂肪分化诱导非编码RNA(ADINR)、心脏肥大相关转录本(CHAST)、DICER1反义RNA 1(DICER1-AS1)、肝细胞癌上调长链非编码RNA(HULC)和NF-κB相互作用lncRNA(NKILA))在42对肺癌样本及相邻非肿瘤组织中的表达水平。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析评估这些转录本区分肿瘤组织与非肿瘤组织的诊断性能。结果:与相邻非肿瘤组织相比,ADINR、C/EBPα、CHAST、ATG5、IL-1B和DICER1-AS1在肿瘤样本中显著上调。在所研究的基因中,C/EBPα在肿瘤组织中表现出最高的上调水平,表达比值为412(95%置信区间(CI):159-1075,P?肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,也是男女癌症相关死亡的首要原因,其中非小细胞肺癌(NSCLC)占大多数。NF-κB信号通路在肺癌发生、发展及治疗抵抗中发挥关键作用,而其相关的促炎与自噬调控网络尚未被充分阐明。长链非编码RNA(lncRNAs)作为重要的调控因子,在多种肿瘤中异常表达,但NF-κB相关lncRNAs在肺癌组织中的系统性表达谱仍缺乏研究。为此,研究人员设计了本研究,旨在评估NF-κB信号通路相关mRNA编码基因(C/EBPα、ATG5、IL-1B)与六种lncRNAs(ANRIL、ADINR、CHAST、DICER1-AS1、HULC、NKILA)在肺肿瘤组织和癌旁正常组织中的表达差异,并探讨其作为组织生物标志物的潜在价值。该论文发表于《Biochemistry and Biophysics Reports》。

研究人员从Masih-Daneshvari、Khatam及Atieh医院收集了42例肺癌患者(37例NSCLC,5例类癌)的肿瘤组织和配对癌旁正常组织标本,采用实时荧光定量PCR检测基因表达,以B2M和TBP作为内参基因,通过效率校正的ΔCt法计算相对表达量;利用ROC曲线、Youden指数评估诊断效能,并采用Spearman相关、层次聚类、动态主成分分析(DPCA)及卡方检验等进行统计与生物信息学分析。

研究结果显示:(1)差异表达分析:与癌旁组织相比,ADINR、C/EBPα、CHAST、ATG5、IL-1B和DICER1-AS1在肺癌组织中显著上调,其中C/EBPα上调幅度最大(表达比值412,q<0.0001),IL-1B次之(31.3),其后依次为DICER1-AS1(12.2)、CHAST(10.57)、ADINR(6.22)和ATG5(5.32)。ANRIL、HULC和NKILA在全队列中差异不显著,但仅纳入NSCLC亚组时ANRIL达到显著上调。(2)相关性分析:所有mRNA与lncRNAs在肿瘤和癌旁组织中的表达均显著相关,最高相关系数出现在癌旁组织的ADINR/C/EBPα对(R=0.83)以及肿瘤组织的IL-1B/CHAST与IL-1B/ATG5对(R=0.83)。(3)聚类与主成分分析:层次聚类将六个上调基因分为四个簇,且大多数肿瘤样本聚集在高表达区域;DPCA显示肿瘤与癌旁样本呈部分分离趋势。(4)ROC曲线评价:C/EBPα的诊断准确率最高(94.12%),AUC为0.95,阳性预测值93.02%,阴性预测值95.12%;IL-1B、CHAST、DICER1-AS1和ADINR的AUC分别为0.84、0.79、0.77和0.74。(5)临床病理关联:C/EBPα和DICER1-AS1的表达水平与患者年龄显著相关,<58岁组表达更高;但未观察到腺癌与鳞状细胞癌之间的表达差异。

讨论部分指出,NF-κB是肺癌发生中的重要转录因子,其调控的促炎与自噬相关基因可能在肿瘤微环境中协同发挥作用。例如,ADINR作为C/EBPα的上游转录本,两者表达平行上调,提示存在协同调控;ATG5可能通过非自噬依赖途径(如影响外泌体产生)参与炎症调节;DICER1-AS1可能经MAPK/ERK轴与NF-κB通路发生交叉对话。然而,研究也承认其局限性,包括样本量较小、包含组织学异质性(NSCLC与类癌)、缺乏蛋白水平验证、内参基因稳定性不理想,以及ROC阈值来自同一回顾性队列,可能高估诊断性能。结论部分翻译:本研究报道了ADINR、C/EBPα、CHAST、ATG5、IL-1B和DICER1-AS1在肺癌组织中的显著上调,其中C/EBPα显示出较高的AUC值,提示这些基因值得作为潜在的组织诊断候选分子进行进一步研究。然而,由于缺乏独立验证、与现有标志物的比较、多变量校正以及充分的亚型分析,目前不能提出任何临床应用主张。未来需要更大规模、多中心、前瞻性研究来确定这些转录本是否能补充现有诊断方法。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号