结核分枝杆菌感染与疾病全谱系中的 Cepheid 9基因宿主 mRNA 表达:跨生命周期的启示

《eBioMedicine》:Cepheid 9-gene host mRNA expression across the spectrum of Mycobacterium tuberculosis infection and disease: insights across the lifespan

【字体: 时间:2026年09月09日 来源:eBioMedicine 11.2

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  背景:使用基于宿主应答的基因特征来区分感染结核分枝杆菌且患有活动性结核病(ATB)、感染细菌但无活动性结核病(TBI)以及无ATB或TBI证据(no TB)个体的新型诊断方案效用有限。年龄相关免疫变化对诊断性能的影响尚不清楚。方法:研究人员使用来自119名10

  
背景:使用基于宿主应答的基因特征来区分感染结核分枝杆菌且患有活动性结核病(ATB)、感染细菌但无活动性结核病(TBI)以及无ATB或TBI证据(no TB)个体的新型诊断方案效用有限。年龄相关免疫变化对诊断性能的影响尚不清楚。方法:研究人员使用来自119名10至24岁“青少年/年轻成人”、259名25至55岁“成人”和79名56岁及以上“老年成人”的血液样本,借助新型研究用途仅限(RUO)Cepheid Xpert TB/LTBI检测评估8个基因靶标的表达。研究人员按结核状态分层绘制各基因相对表达,并构建两个由部分基因靶标组成的复合分类器,在各年龄层内通过logistic回归模型所得AUC进行比较。结果:IL2、IFNG和MIG似乎最能区分TBI或ATB与no TB,所建“暴露”分类器在青少年/年轻成人AUC为0.89(95% CI 0.83–0.96),成人0.82(95% CI 0.76–0.87),老年成人0.71(95% CI 0.58–0.84)。SLPI、VEGFA、PLAU和GBP5似乎最能区分ATB与TBI或no TB,相应“疾病”分类器在青少年/年轻成人AUC为0.88(95% CI 0.80–0.96),成人0.74(95% CI 0.66–0.82),老年成人0.56(95% CI 0.40–0.73)。解读:该研究证明在开发与评价基于宿主应答的ATB和TBI诊断时需考虑年龄,并提示此类诊断在青少年/年轻成人中区分ATB、TBI和no TB最可能具有价值。资助:美国国防部(award number W81XWH-18-1-0253)与美国国立卫生研究院(award number R01AI137681)支持本研究,薪酬支持来自NIH培训基金T32AI007384。
研究背景:全球约四分之一人口感染结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,TBI),每年约1080万感染者发展为活动性结核病(active tuberculosis,ATB)。准确识别TBI与ATB是降低发病和死亡的关键。现有ATB诊断多依赖病原体检测,如培养、涂片与分子方法,并辅以放射学;基于宿主的方法如结核菌素皮肤试验(TST)和干扰素γ释放试验(IGRAs)可检测感染,但会漏检部分培养阳性者。目前缺乏能同时区分ATB、TBI与无结核(no TB)的可靠血液诊断。年龄与免疫功能差异使问题更复杂:儿童ATB检出敏感性低,老年人TBI假阴性高。基于血液宿主基因表达特征的研究虽有探索,但多未将年龄作为核心分析维度,“一刀切”策略与全生命周期免疫发育认知不符。因此,研究人员在巴基斯坦开展研究,评价Cepheid研究用途仅限(RUO)Xpert TB/LTBI检测在ATB、TBI与no TB鉴别中的年龄分层表现。论文发表于《eBioMedicine》。
关键技术方法:研究人员在巴基斯坦伊斯兰堡Federal General Hospital与Rawalpindi Leprosy Hospital于2022年5月至2023年5月纳入≥5岁、有结核样症状并被转介做Xpert MTB/RIF Ultra的序贯患者,排除近6个月ATB治疗、被监禁或机构化者;最终分析排除<10岁者,保留457人,分为10–24岁、25–55岁、≥56岁三层。采用RUO Lionex管以ESAT-6与CFP-10抗原刺激静脉血,GeneXpert平台做核酸分离、cDNA合成与并行qPCR,以看家基因CDE3计算相对Ct值。用Wilcoxon秩和检验比较流程与孵育等因素,构建“暴露”分类器(IL2+IFNG+MIG)与“疾病”分类器(SLPI+VEGFA+PLAU+GBP5),以logistic回归在各年龄层求AUC。
Participant characteristics:研究人员比较各年龄组人口学与临床特征。老年成人异常放射表现更多,成人QFT-plus阳性率更高,各年龄组症状与复合结核状态无显著差异。
Gene specific relative Ct values by TB status:研究人员用热图与散点拟合线展示各基因相对Ct。IL2、IFNG、MIG在ATB/TBI与no TB间分布差异明显,且青少年/年轻成人最显著;SLPI、VEGFA、PLAU在ATB中上调、在TBI/no TB中相近;GBP1P1与GBP5随ATB→TBI→no TB递减。年龄增大后拟合线趋同,55岁以上更明显。
Impact of process workflow, incubation time, diabetes status, and sex on relative Ct values:研究人员发现live与frozen流程、孵育时间、糖尿病状态对部分基因相对Ct有显著影响,性别无显著影响,故将前三者纳入AUC模型。
Composite classifier variables:研究人员评价两个分类器。暴露分类器全人群AUC 0.823,青少年/年轻成人0.891,成人0.816,老年成人0.710;疾病分类器全人群0.743,青少年/年轻成人0.880,成人0.740,老年成人0.564。结果表明年龄增长削弱分类器判别力,青少年/年轻成人收益最大。
讨论部分总结:研究人员指出,IL2、IFNG、MIG上调符合IGRA原理;PLAU、SLPI、VEGFA在ATB上调契合组织侵袭与血管通透等病理过程;GBP5与GBP1P1可区分三态但与肉芽肿性疾病交叉。青少年/年轻成人因适应性免疫成熟且全局暴露与背景炎症较低,形成“Goldilocks”式最佳诊断窗口;老年人因免疫衰老与背景炎症致信号收敛。多数既往研究未把年龄作效应修正因子,导致“一刀切”标志性能不佳。局限为单国单队列、用同批数据建与评分类器、HIV少见、缺乏外部验证与合并感染特异性评估。
结论翻译:总体而言,青少年/年轻成人免疫系统的最大应答能力,加上相较于全生命周期而言相对较低的全局暴露与背景炎症程度,可能产生一种“Goldilocks”效应,显示出转录组结核诊断在该年龄组的潜在效用。尽管TB/LTBI检测在青少年/年轻成人中可能比老年人效用明显更高,仍亟需进一步评价以确定其外推性。最后,在评估和开发量化结核分枝杆菌感染与疾病中适应性免疫系统多方面应答的宿主应答检测时,必须考虑年龄效应。Marva Seifert、Michael Gracia、Donald G. Catanzaro、Faiqa Rashid、Rehan R. Syed、Faisal Masood、Naomi Hillery、Alamdar Hussain、Ashley Swing、Rebecca E. Colman、Uzma Majeed、Antonino Catanzaro、Sabira Tahseen、Timothy C. Rodwell 来自加州大学圣迭戈分校医学系肺、重症与睡眠医学科。
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