基于SSR分子标记的259份大蒜种质资源遗传多样性分析及核心种质库构建

《BMC Plant Biology》：Genetic diversity analysis and core collection construction of 259 garlic germplasm resources based on SSR molecular markers

　　## 摘要本研究利用23对SSR引物对259份大蒜种质进行扩增和毛细管电泳检测，通过基于位点的统计方法评估遗传多样性和聚类关系。基于等位基因最大化原则，使用Powercore软件鉴定核心种质库，并通过GenAlex软件计算的遗传参数以及主坐标分析（PCoA）评估其代表性。结果表明，23对SSR引物共检测到171个多态性位点，平均每对引物具有7.43个等位基因。多态性信息含量（PIC）范围为0.081～0.669，平均值为0.407；有效等位基因数（Ne）变化范围为1.04～3.79；Shannon多样性指数（I）平均值、观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）及Nei多样性指数（H）分别为0.938、0.488、0.517和0.482。聚类分析将259份种质材料分为5个聚类群，其中部分聚类群表现出相同的扩增谱。去除相同位点的重复材料后，利用23对引物鉴定出100份不同的种质材料。共筛选出50份核心种质，占原始种质库的19.31%。与原始种质库相比，核心种质库保留了100%的等位基因，其Ne为原始的155.20%，I为原始的137.15%。此外，核心种质库在PCoA图中呈均匀分布，证实了其代表性。根据独特等位基因数量及可区分种质数，从23对SSR引物中鉴定出13对核心引物，据此构建了50份核心种质的指纹图谱。这些发现将有助于高效筛选、保存和利用大蒜种质资源，支持遗传多样性的保护，并促进新品种的选育。