全球视野下塞内加尔豇豆种质资源的群体结构与遗传多样性

《Scientific Reports》：Population structure and genetic diversity of cowpea germplasm from Senegal within a global framework

　　

摘要

表征作物种质的遗传多样性是其育种计划中有效利用的关键。本研究利用Illumina Cowpea iSelect联盟芯片（51,128个SNP标记）对来自塞内加尔的95份豇豆（Vigna unguiculata）种质进行了基因分型，其中包括栽培种、中间类型和野生种。我们首先将塞内加尔种质集合的遗传多样性与代表全球栽培豇豆多样性的UCR迷你核心种质集合进行了比较，然后对塞内加尔种质进行了详细分析。主成分分析和群体结构分析在最优K值（K = 9）下揭示了UCR迷你核心种质中先前已识别的六个聚簇，以及三个塞内加尔种质集合独有的附加群体。塞内加尔栽培种质的遗传多样性在所有迷你核心亚群体中名列前茅。这些结果表明，塞内加尔豇豆种质是拓宽全球豇豆多样性的重要遗传资源。在塞内加尔种质集合中，群体结构并未始终反映地理来源，圣路易地区的种质除外。野生种质形成了一个独立且均匀的聚簇。总体而言，观察到的多样性突显了识别有益等位基因并在豇豆育种计划中加以利用的广阔前景。