松鼠猴巨细胞病毒编码的一种独特的病毒MHC-I类样蛋白

《Scientific Reports》：An exceptional viral MHC class I-like protein encoded by squirrel monkey cytomegalovirus

　　

摘要

病毒与宿主的相互作用促进了病毒基因组获取宿主来源遗传物质的现象，但此类事件背后的机制仍未被完全阐明。本研究鉴定了松鼠猴巨细胞病毒（Saimiriine herpesvirus 4；SBHV4）的S9蛋白，它是一种独特的病毒蛋白，与哺乳动物主要组织相容性复合体I类分子（MHC I类分子）表现出广泛的相似性。SBHV4-S9在人类HLA-A蛋白全长序列的86.3%区域内具有60.6%的氨基酸同一性，这是基于Virus-Host DB筛选中已发现的病毒蛋白与MHC I类分子之间最高的相似水平。结构建模显示，SBHV4-S9具有与HLA-A高度相似的整体架构，包括典型的MHC I类结构域。对灵长类MHC I类样基因进行的全面系统发育分析，结合替代饱和度评估、潜在重组信号检测以及全长序列与非肽结合区域的比较，表明SBHV4-S9始终与旧世界猴MHC I类序列聚为同一分支，包括Cercopithecus属的序列。然而，MHC I类基因复杂的演化历史使得无法确定供体谱系或获取机制。这些发现将SBHV4-S9鉴定为一种非凡的病毒MHC I类样蛋白，并突显了重建古代病毒-宿主演化事件的复杂性。