肠道微生物群落模式与一个富含普雷沃氏菌（Prevotella）和酿酒酵母（Saccharomyces）的队列中HIV相关宿主参数有关

《Scientific Reports》：Gut microbial community patterns are associated with HIV-related host parameters in a Prevotella- and Saccharomyces-rich cohort

　　

摘要

尽管现代抗逆转录病毒疗法能够有效抑制病毒，但艾滋病（HIV）仍然是一种慢性疾病，会对人体造成长期的影响，包括对肠道微生物生态的显著改变。我们分析了94名HIV感染者的粪便细菌（16S rRNA基因）和真菌（ITS）谱型数据——这是捷克共和国迄今为止规模最大的相关研究队列——以探讨抗逆转录病毒疗法（ART）方案、治疗持续时间以及血液参数如何影响肠道微生物组的多样性和组成。细菌群落主要由巴氏杆菌门（Bacillota）和拟杆菌门（Bacteroidota）构成。普雷沃氏菌属（Prevotella）是最丰富的细菌属，同时我们也检测到了几种与短链脂肪酸（SCFA）生成相关的细菌属，例如费卡利巴菌属（Fecalibacterium）。真菌群落表现出显著的个体间差异，其中酿酒酵母属（Saccharomyces）是最主要的真菌属。生态网络分析显示，不同ART治疗持续时间的组间微生物相互作用存在差异，治疗时间较短的参与者其微生物相互作用网络更为复杂。此外，细菌的α多样性也随着ART治疗时间的延长而发生变化。一些与普雷沃氏菌属相关的分类单元以及柳叶螺旋菌科（Lachnospiraceae）的成员与病毒载量有关，而甘油三酯水平则与包括异普雷沃氏菌属（Alloprevotella）和普雷沃氏菌属9型（Prevotella 9）在内的某些分类单元相关。总体而言，我们的研究结果表明，ART治疗持续时间所导致的差异在微生物共现模式上可能比在整体分类群落组成上更为明显。