基于质谱的高丰度血清蛋白质组全基因组关联研究揭示13种蛋白与疾病的潜在因果关联

《Nature Communications》：Genome-wide analysis of 439 mass spectrometry-based proteomic profiles in a population of 15,035 Scottish individuals

　　理解循环蛋白质组的遗传架构有助于确定某种蛋白质是否与疾病存在因果关系。以往的大规模蛋白质全基因组关联研究大多针对预定义的、定向的蛋白质组子集进行，并通常聚焦于低丰度蛋白质，而其中许多蛋白质的主要功能并非在血清中发挥。基于质谱的蛋白质组学技术促进了对高丰度蛋白质及其异构体的研究，重点关注在血液中发挥活性作用的蛋白质。在苏格兰世代研究（Generation Scotland）的15035名个体中，我们对通过液相色谱串联质谱技术鉴定和定量的439个高丰度血清蛋白质组进行了全基因组关联研究。我们鉴定了398种蛋白质的1553个独立SNP信号（P < 1.2×10^?10）。采用两样本孟德尔随机化分析，检验具有显著SNP信号的398种蛋白质是否与79种常见致病和致死原因存在因果关联。我们报告了13种蛋白质与17种结局之间潜在的因果关联，包括神经精神疾病和心血管疾病。对高丰度蛋白质组进行的大规模全基因组分析可以补充靶向方法，有助于发现疾病的因果通路。