《Virulence》:EspF acts as a molecular scaffold to facilitate TRIM25-mediated NLRP3 inflammasome activation during mycobacterial infection
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分枝杆菌 ESX-1(Type VII)分泌系统对毒力至关重要,并可诱导 NLRP3 炎症小体激活。然而,除已充分研究的 EsxA(ESAT-6)外,参与该过程的具体细菌效应蛋白仍大多未被鉴定。研究人员通过对 ESX-1 效应蛋白进行系统筛选,鉴定出 EspF
分枝杆菌 ESX-1(Type VII)分泌系统对毒力至关重要,并可诱导 NLRP3 炎症小体激活。然而,除已充分研究的 EsxA(ESAT-6)外,参与该过程的具体细菌效应蛋白仍大多未被鉴定。研究人员通过对 ESX-1 效应蛋白进行系统筛选,鉴定出 EspF 是结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)、牛分枝杆菌(M. bovis)和海分枝杆菌(M. marinum)等致病分枝杆菌中一种强效且进化保守的 NLRP3 炎症小体激活因子。研究结果表明,EspF 可显著增强 THP-1 细胞中成熟 IL-1β 和 IL-18 释放、ASC 斑点形成、caspase-1 激活以及 gasdermin D(GSDMD)介导的细胞焦亡(pyroptosis)。值得注意的是,感染过表达 EspF 的耻垢分枝杆菌(M. smegmatis)或牛分枝杆菌卡介苗(BCG)菌株可显著增强 NLRP3 炎症小体激活和细胞焦亡,而在 NLRP3 缺陷细胞中这些效应被完全消除。机制上,EspF 直接与 NLRP3 的 NACHT 和 LRR 结构域相互作用;无偏蛋白质组学筛选进一步鉴定宿主 E3 泛素连接酶 TRIM25 为关键结合伙伴。研究人员在 THP-1 细胞中证实了 EspF–TRIM25–NLRP3 复合物的内源性相互作用和共定位,证明 EspF 作为分子支架将 TRIM25 桥接到 NLRP3。该邻近互作在分枝杆菌感染期间经原位验证,可促进 TRIM25 介导的 NLRP3 K63 连接泛素化。体内实验中,过表达 EspF 的 BCG 感染小鼠出现肺病变加重、炎症细胞浸润增加和菌载升高。综上,EspF-TRIM25-NLRP3 轴是分枝杆菌致病的新机制,可驱动过度炎症以促进细菌存活和播散。
研究背景方面,结核病(tuberculosis, TB)由结核分枝杆菌(M. tuberculosis, Mtb)引起,仍是全球单一传染因子导致死亡的首要原因。尽管卡介苗(Bacille Calmette-Guérin, BCG)和多药治疗已使用数十年,耐多药和广泛耐药菌株仍威胁公共卫生。Mtb 作为高度适应的胞内病原体,主要靶向肺泡巨噬细胞并操纵宿主免疫。NLRP3 炎症小体可成熟 IL-1β 与 IL-18 并通过 GSDMD 介导细胞焦亡,炎症反应具“双刃剑”效应:既参与早期抑菌,也可致过度炎症和组织损伤。ESX-1(Type VII)分泌系统对吞噬体膜破坏及效应蛋白转位至胞质必不可少,且为 NLRP3 激活所需;但除 EsxA(ESAT-6)外,其他 ESX-1 效应蛋白如何调控 NLRP3 仍不清楚。因此,鉴定未知细菌调节因子对理解分枝杆菌致病机制、开发宿主导向治疗(host-directed therapies, HDTs)具有重要意义。研究人员开展系统筛选,发现保守 ESX-1 效应蛋白 EspF 可作为分子支架招募 TRIM25 至 NLRP3,促进 K63 连接泛素化、炎症小体激活与焦亡,并在体内加剧肺病损和菌载。该论文发表于《Virulence》。
主要关键技术方法方面,研究人员使用 HEK293T 与 THP-1 细胞模型、慢病毒诱导表达系统、siRNA 敲低与 CRISPR/Cas9 敲除细胞系;通过免疫共沉淀(co-immunoprecipitation, Co-IP)、体外 pull-down、激光共聚焦显微镜、无偏液相色谱串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)蛋白质组学筛选、邻近连接原位 assay(proximity ligation assay, PLA)分析蛋白邻近;感染模型包括重组耻垢分枝杆菌与 BCG 感染巨噬细胞;体内为 SPF 级 C57BL/6 小鼠气溶胶感染约 200 CFU 的队列,于 30 天评估肺菌载、H&E 与抗酸染色病理。
研究结果方面,EspF promotes NLRP3 inflammasome activation and pyroptosis:研究人员将 11 种 ESX-1 效应蛋白与 NLRP3、ASC、pro-caspase-1、pro-IL-1β 共转 HEK293T,以上清 IL-1β 为指标,发现 EspF 激活最强;Mtb、M. bovis 与 M. marinum 的 EspF 序列高度保守且均促激活;在 DOX 诱导 THP-1-EspF 巨噬细胞中,LPS 加 nigericin 刺激才显著增强 IL-1β、IL-18、caspase-1 活化、ASC 斑点、GSDMD 裂解与 LDH 释放,说明 EspF 是已启动 NLRP3 信号的放大效应子。
EspF augments NLRP3 inflammasome activation during mycobacterial infection:构建过表达 EspF 的 M. smegmatis(Ms_EspF)与 BCG(BCG_EspF),亚细胞分级证明 EspF 转位至宿主胞质;感染 THP-1 后 IL-1β、caspase-1 活化、GSDMD 裂解、LDH 释放与 ASC 寡聚均高于空载体,且在 NLRP3 缺陷细胞中全部消失,证实 EspF 依赖 NLRP3 增强感染期炎症小体激活与焦亡。
EspF interacts directly with the NACHT and LRR domains of NLRP3:Co-IP 显示 EspF 只与 NLRP3 结合而不结合 ASC 或 pro-caspase-1;体外 pull-down 证直接结合;共聚焦显示胞质共定位;结构域作图表明 EspF 结合 NLRP3 的 NACHT(220-536)与 LRR(742-991)而非 PYD(1-93)。
TRIM25 is indispensable for EspF-induced NLRP3 inflammasome activation:LC-MS/MS 筛得 TRIM25 为高置信互作者;Co-IP、共聚焦与 pull-down 证 EspF–TRIM25 直接结合;在 THP-1-EspF 中用 siRNA 敲低 TRIM25 后,LPS 加 nigericin 诱导的 IL-1β 分泌、caspase-1 活化、GSDMD 裂解与细胞死亡均被削弱,表明 TRIM25 为必需宿主因子。
EspF recruits TRIM25 to promote K63-linked NLRP3 ubiquitination:Co-IP 与 pull-down 证 TRIM25 直接结合 NLRP3 的 NACHT/LRR;EspF 剂量增加可增强 TRIM25–NLRP3 结合;内源 THP-1 模型与 PLA 在 Ms_EspF 感染中均显示 TRIM25–NLRP3 邻近信号增多;CRISPR 敲除 TRIM25 的 HEK293T 中,EspF 促 NLRP3 总泛素化与 K63-only 泛素化均消失,证明 EspF 支架作用促成 TRIM25 介导的 NLRP3 K63 连接泛素化。
EspF promotes mycobacteria survival in vivo:C57BL/6 小鼠气溶胶感染 BCG_EspF 或 BCG_Vec 各约 200 CFU,30 天后 BCG_EspF 组肺大体病变更重,H&E 示炎症面积增加,肺组织 GSDMD 裂解增强,肺匀浆 7H10 平板计数菌载更高,抗酸染色见更多抗酸杆菌,说明 EspF 促体内分枝杆菌定植、播散与肺病理损伤。
讨论部分总结方面,研究人员指出 ESX-1 胞质进入是分枝杆菌炎症小体激活核心,EsxA 之外仍有其他效应子;EspF 是主导性 NLRP3 激活因子,其结合 NACHT/LRR 与 PPE13 策略相似,可能稳定 NLRP3 开放构象。NLRP3 受泛素化等翻译后修饰调控,TRIM25 既往以抗病毒 RIG-I 通路闻名,本研究揭示其细菌感控中正调 NLRP3:EspF 作支架招募 TRIM25 行 K63 连接泛素化。TRIM 家族成员可双向调控 NLRP3,说明该轴非孤立。体内 EspF 致过度炎症虽 IL-1 信号抗 TB,但焦亡与组织损伤反成利于菌存的炎症生态位;研究用重组 BCG 而非毒力 Mtb,EspF 在潜伏与复发期作用待考。
研究结论部分翻译:综上所述,研究人员鉴定 EspF 为一种新颖且保守的 ESX-1 效应蛋白,其通过 TRIM25 依赖机制直接靶向 NLRP3 炎症小体。结合既往其他分枝杆菌炎症小体调节效应蛋白研究,本发现支持这样一种模型:致病分枝杆菌部署机制多样的策路来精细调节炎症小体信号,使之走向有利于持久感染与病理的结果。这些见解深化了对分枝杆菌毒力机制的理解,并凸显包括 EspF–TRIM25–NLRP3 轴在内的炎症小体调节节点,可作为结核病宿主导向治疗的潜在靶点。