中国六个省份HIV-1 CRF67_01B的时空动态与跨区域传播网络

《Virology Journal》：Spatiotemporal dynamics and cross-regional transmission network of HIV-1 CRF67_01B in six provinces in China

　　

摘要

背景

新兴重组毒株的跨区域传播对HIV-1的防控构成了重大挑战。HIV-1 CRF67_01B于2013年首次在中国被发现，此后在多个省份均有报告。本研究旨在阐明该毒株的来源及跨区域传播途径。

方法

收集了来自杭州的CRF67_01B HIV-1 pol序列，并从洛斯阿拉莫斯国家实验室（LANL）HIV序列数据库检索了来自中国其他地区已公开的报告序列。构建基于遗传距离的分子网络以识别可能的传播链。采用贝叶斯系统地理学方法，结合贝叶斯随机搜索变量选择（BSSVS），推断各省份之间的历史迁移路径并估算最近共同祖先时间（tMRCA）。

结果

共纳入来自6个省份的183条于2011年至2024年间采集的CRF67_01B序列。在遗传距离阈值设为0.6%的条件下，分子网络识别出24个传播簇，入簇率为54.1%（99/183）。男性同性性行为者（MSM）占簇内个体的91.9%（91/99）。省际可能的传播链主要分布在江苏与杭州之间。贝叶斯系统地理学推断CRF67_01B约起源于2007年的江苏省。该毒株在2009年至2011年间呈指数增长，2017年至2020年间有所下降，随后趋于平稳。主要迁移路径包括江苏至杭州、杭州至安徽，以及从江苏、杭州、安徽和宁波至广东。

结论

CRF67_01B在MSM人群中已形成高度互联的本地传播网络和多重跨区域传播链。杭州的疫情并非孤立事件，而是与周边及更早的疫情中心存在流行病学关联。这些发现强调了针对新兴HIV-1重组毒株实施跨区域联合防控策略的重要性，重点应关注枢纽城市及高危MSM人群。