《Environmental DNA》:Temporal Persistence of Vertebrate Airborne Environmental DNA in a Natural Open-Air Setting
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空气环境DNA(Airborne environmental DNA, eDNA)是一种有前景的工具,可从散落到空气中的微量遗传物质检测广泛的陆生分类群,包括受威胁物种和入侵物种。然而,该技术在物种管理中的应用受到对空气eDNA生态学(包括开放环境中信号的时间
空气环境DNA(Airborne environmental DNA, eDNA)是一种有前景的工具,可从散落到空气中的微量遗传物质检测广泛的陆生分类群,包括受威胁物种和入侵物种。然而,该技术在物种管理中的应用受到对空气eDNA生态学(包括开放环境中信号的时间持久性)有限认知的制约。研究人员以入侵性贝内特小袋鼠(Notamacropus rufogriseus)为案例,研究了自然户外环境中空气eDNA的时间持久性。研究人员从一具贝内特小袋鼠尸体中捕获空气eDNA,该尸体被放置在一个原本没有袋鼠的区域。共采集180份样品,分别在尸体部署前、尸体在现场的11天期间以及尸体移除后的32天内采集,采样距离为1、10和100 m,同时使用主动(风扇辅助)和被动(无风扇)采集方法。尽管总体检出率较低,但在袋鼠被引入现场后不久,可在100 m外检测到袋鼠DNA,并在其移除后持续检测长达3天。这些发现表明空气eDNA仅短暂存续。使用电池驱动风扇主动采集空气相比被动采样显著提高了检出率。研究人员证明,空气eDNA能够在户外环境中检测到单个生物个体,但可靠检测需要强健的采样和重复,以捕获稀有、短暂的信号。通过揭示这些信号如何随时间存续,研究结果可为优化野外部署和区分残留DNA与新入侵提供框架。
空气环境DNA(Airborne environmental DNA, eDNA)是一种新兴的非侵入性采样方法,能够从空气中捕获生物释放的微量遗传物质,从而检测鸟类、哺乳动物、两栖爬行类等陆生分类群,对珍稀、隐秘物种和入侵物种监测具有巨大潜力。然而,空气eDNA生态学认知的匮乏,特别是开放自然环境中信号的时间持久性,严重制约了该技术的实际应用。若不清楚信号能存续多久,将无法判断检测结果代表近期生物活动还是历史残留,这在入侵物种管理中至关重要。以往研究多在封闭或半封闭空间进行,发现信号在移除源头后数天内消失,但开放环境中风、降雨、光照和温度等因素可能使持久性更短或空间分布更复杂。为此,研究人员以新西兰入侵性贝内特小袋鼠(Notamacropus rufogriseus)作为案例,在奥塔哥半岛一处无袋鼠的自然保护区(Otago Peninsula Eco Restoration Alliance, The OPERA)开展实验,使用一具成年雌性袋鼠尸体作为单一已知DNA源,定量评估空气eDNA的时间持久性、距离衰减、采样方法差异及环境因素影响。该研究为优化入侵物种监测方案、区分残留DNA与新入侵提供了科学依据,论文发表于《Environmental DNA》。
研究方法方面,研究人员采用主动(风扇辅助)和被动(无风扇)两种空气采样器,成对部署在距尸体1、10和100 m的9个位点,采样高度1.5 m。实验分三个阶段:尸体部署前采集18份阴性对照;尸体存在11天期间采集108份;尸体移除后32天采集102份,合计228份样品。所有样品通过qPCR检测线粒体MT-ND2基因,使用特异性引物探针,并设置严格阴性和阳性对照。统计上,利用广义线性模型(GLM)、主成分分析(PCA)、二项检验、Kruskal–Wallis检验和分段回归等处理检测