转录调控元件的方向性

《Nature Communications》：Directionality of transcriptional regulatory elements

　　

摘要

在哺乳动物中，差异转录是活跃转录调控元件（TREs，包括增强子和启动子）的重要标志。然而，那些具有单向转录模式的远端元件经常被忽视，导致它们的身份和功能了解不足。在这项研究中，我们对差异转录元件和单向转录元件进行了系统的比较，揭示了它们在结构和功能上的显著差异。分析还表明，单向转录元件的序列年龄较新，受进化约束较弱，这暗示它们可能代表一类具有更近期起源的独特基因组调控功能。此外，我们探讨了参与TREs转录方向性的相关因素，发现CTCF和ZNF143在转录调控中具有双重且位置依赖性的作用。总体而言，对转录方向性的阐明有助于我们更好地理解TREs多样的结构模型、功能特征、进化动态及其调控逻辑。