1型糖尿病两种模型中视网膜蛋白质组学分析

《Biomolecules》:Proteomic Analysis of Retinas from Two Different Type-1 Diabetic Models

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月11日 来源:Biomolecules 5.6

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  本研究利用两种糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的1型糖尿病(type-1 diabetes mellitus,T1DM)小鼠模型,即遗传性Ins2akita/+(Akita)模型与链脲佐菌素(streptozotocin,ST

  
本研究利用两种糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的1型糖尿病(type-1 diabetes mellitus,T1DM)小鼠模型,即遗传性Ins2akita/+(Akita)模型与链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)诱导糖尿病模型,探讨T1DM相关视网膜蛋白质组改变。糖尿病发生后15–16周收集Akita(n=4)与STZ诱导糖尿病小鼠(n=6)视网膜,并与年龄匹配对照组比较。定量质谱在Akita视网膜鉴定7933个蛋白质,在STZ视网膜鉴定7399个蛋白质。研究人员使用校正后p值与log2倍变化识别差异表达蛋白质,按曼哈顿距离(Manhattan distance)排序,并以火山图与热图可视化。两模型各取前20个失调蛋白质进行经典通路分析。两模型均显示炎症与血管生成相关蛋白质上调,包括LRRC58、coronin-2A、S100-A4与COL4A2,支持促炎与血管重塑微环境。但两模型部分蛋白质变化不同,如晶体蛋白(crystallins)在STZ模型下调、在Akita模型上调,并经Western blot验证。经典通路分析显示血小板相关信号通路激活、脂质代谢网络富集以及细胞外基质(extracellular matrix,ECM)组织显著改变。这些发现表明DR中存在协调的炎症、代谢与结构重塑,并识别出可作为进一步研究与治疗靶点的候选分子通路。
研究背景方面,糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)是糖尿病(diabetes mellitus,DM)重要微血管并发症,也是全球视力损害与盲的主要原因之一。DR患病率预计在未来数十年显著上升。其病理从非增殖性DR(non-proliferative DR,NPDR)进展至增殖性DR(proliferative DR,PDR),伴随血视网膜屏障(blood-retinal barrier,BRB)破坏、血管渗漏与视网膜新生血管。现有激光光凝与玻璃体内药物如抗血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)等治疗存在副作用。Akita小鼠(Ins2akita/+)与链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)诱导小鼠均为T1DM模型,但两模型视网膜损伤分子机制仍不完全清楚。高分辨质谱发展使更全面视网膜蛋白质组表征成为可能,因此研究人员开展探索性发现蛋白质组学研究,论文发表于《Biomolecules》。
关键技术方法方面,研究人员使用雄性Akita小鼠与STZ诱导雄性野生型小鼠,另设年龄匹配野生型对照,糖尿病发生后约16周取眼球并分离视网膜;Akita组n=4、对照n=4,STZ组n=6、对照n=5。样本经匀浆与酶解后,采用数据非依赖采集(data-independent acquisition,DIA)质谱与Orbitrap Eclipse仪器进行定量蛋白质鉴定。数据分析使用VolcaNoseR绘制火山图,按曼哈顿距离排序;R进行z分数标准化与双向层次聚类热图;QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis(IPA)做经典通路富集;STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络与功能富集;并以Western blot验证候选晶体蛋白。
3.1. Top 20 Dysregulated Proteins in Akita Group
研究人员通过火山图与曼哈顿距离排序获得Akita组前20个失调蛋白质,其中15个上调、5个下调。免疫球蛋白κ常数区(immunoglobulin kappa constant,IGKC)上调最显著,WAP四二硫键核心域蛋白12(WFDC12)下调最明显。热图显示Akita样本与对照分离,免疫球蛋白相关、急性期蛋白与丝氨酸蛋白酶抑制剂协调上调,CryβB2与神经元相关蛋白下调。
3.2. Canonical Pathway Analysis of Akita Group
IPA显示整合素细胞表面相互作用富集最显著。Z分数预测血小板胞质Ca2+反应、急性期反应信号、内源性配体调控TLR(Toll-like receptor)、LXR/RXR激活与DHCR24信号激活;整合素细胞表面相互作用、GP6信号、胶原纤维与其他多聚体结构组装、胶原降解受抑制。
3.3. Top 20 Dysregulated Proteins in STZ Group
STZ组前20个失调蛋白质中10个上调、10个下调。主要尿蛋白20(major urinary protein 20,MUP20)上调最显著,γ-crystallin B下调最显著。热图显示STZ样本聚为一类,α、β、γ晶体蛋白家族协调下调,IgHm、Thra、Ermn、Clic6等呈组别差异表达。
3.4. Canonical Pathway Analysis of STZ Group
IPA显示细胞外基质(extracellular matrix,ECM)组织、胶原链三聚化与中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular trap,NET)信号富集。多数通路上调,NET信号预测受抑制,肝纤维化/肝星状细胞激活无明确方向。
3.5. PPI Network Analysis
Akita组14个显著失调蛋白质中12个进入STRING网络,仅S100a6–S100a4与Serpina1e–Orm1有互作,其余节点离散。STZ组8个中7个进入网络,仅Crygc–Crygb有强功能连接,其余节点无预测互作。两模型无重叠显著失调蛋白质。
3.6. Functional Enrichment and Pathway Analysis of the Dysregulated Proteins
Akita组GO与Reactome富集聚焦胶原与ECM架构、血小板源生长因子结合、S100蛋白结合及胶原纤维交联。STZ组富集聚焦相机型眼晶状体发育、结构 constituent of eye lens、剪接体复合体、ECM组织、角质化与胶原含ECM。
3.7. Retinal Expression of β B-Crystallins in Akita and STZ Mice
Akita组βB2-crystallin(βB2-Crys)Western blot呈非显著上升趋势;STZ组独立三批样本显示βB2-Crys较对照显著下降,与蛋白质组方向一致。
讨论部分总结,研究人员指出Akita与STZ模型虽无共同显著失调蛋白质,但共享炎症、ECM重塑与脂质代谢等通路,说明遗传与化学诱导T1DM通过不同节点进入共同功能障碍网络。Akita视网膜晶体蛋白上调可能具代偿神经保护意义,STZ视网膜晶体蛋白下调提示内源保护机制受损。免疫球蛋白、急性期蛋白、血小板与凝血相关通路支持DR慢性炎症与血管应激。ECM相关通路在Akita偏抑制、在STZ偏激活,反映模型间基质重塑模式不同。LRRC58、coro2a、S100-A4、COL4A2等可作为DR炎症与血管重塑候选靶点。样本量较小但严格阈值使发现集仍具探索价值。
结论部分翻译如下:
总体而言,蛋白质组学分析识别出大量具有机制与治疗相关性的DR失调蛋白质。LRRC58与coronin-2A在两模型一致上调,支持促炎视网膜环境;S100-A4与COL4A2升高符合血管生成与血管重塑过程。相反,若干晶体蛋白家族成员下调,提示内源应激反应与神经保护机制受损。恢复晶体蛋白通路是否具治疗获益值得研究。经典通路分析显示血小板相关信号激活,提示血小板活性增强、微血栓形成及可能的血视网膜屏障破坏;脂质相关通路富集指示代谢失调,ECM组织与重塑显著改变,与DR结构性血管变化一致。上述通路层面发现为机制优先级排序与目标验证提供系统框架。
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