伊拉克急性胃肠炎儿童中人类短托病毒的分子检测、系统发育表征及炎症生物标志物

《BMC Research Notes》：Molecular detection, phylogenetic characterization, and inflammatory biomarkers of human torovirus in iraqi children with acute gastroenteritis

　　

摘要

目的

人类托罗病毒（HToV）是一种公认的肠道病原体，与急性胃肠炎相关，但有关其流行传播、分子特征和遗传多样性的信息仍然有限，尤其是在发展中国家。

方法

2023年12月至2024年8月期间，从伊拉克巴格达一家三级医院的儿科住院患者中收集了200份粪便样本。采用一步法实时RT-qPCR检测病毒RNA。选取部分阳性样本，通过常规RT-PCR针对核衣壳（N）基因进行进一步分析，随后进行Sanger测序和系统发育分析。

结果

在40份（20%）样本中检测到了HToV RNA。HToV阳性患者中最常见的临床表现包括水样腹泻（100%）、腹痛（100%）、发热（85%）和呕吐（77.5%）。与HToV阴性的胃肠炎患者相比，HToV阳性的胃肠炎患者淋巴细胞百分比和血小板计数升高，同时中性粒细胞百分比和血红蛋白水平降低。感染儿童的血清IFN-γ、IL-6和CRP水平显著升高。序列分析显示，与已报告的HToV参考毒株具有约99%的核苷酸同一性，而与动物来源的托罗病毒毒株的核苷酸相似性较低。系统发育分析表明，伊拉克分离株与已报告的HToV谱系聚为一簇。

结论

本研究首次对伊拉克急性胃肠炎儿科患者中的HToV进行了基于分子和序列的特征分析。所分析的HToV分离株在部分核衣壳（N）基因中显示出高度保守的核苷酸特征。与HToV阴性的急性胃肠炎儿童相比，HToV阳性儿童表现出不同的血液学和免疫学变化，但由于未检测其他肠道病毒，这些结果应谨慎解读。这些结果支持将HToV纳入常规分子监测。