酒精戒断与海马体中PCBP1 RNA结合改变相关

《BMC Genomics》：Alcohol withdrawal is associated with altered PCBP1 RNA binding in the hippocampus

　　

摘要

背景

慢性酒精暴露的戒断会扰乱大脑基因表达和RNA剪接程序。多功能RNA结合蛋白PCBP1此前已被发现在慢性酒精（乙醇）暴露戒断期间参与海马体的RNA选择性剪接。然而，乙醇戒断期间与PCBP1相关的转录组水平RNA靶标尚不清楚。在本研究中，我们使用针对PCBP1的抗体的RNA免疫共沉淀与测序（RIP-Seq）技术，生成了雄性大鼠和雌性大鼠在慢性乙醇暴露后24小时戒断期间海马体PCBP1 RNA结合的图谱。

结果

经过多重检验校正后，没有任何单独的PCBP1相关RNA峰达到显著水平；因此，未校正 p 值?<?0.01阈值的峰被认为是名义上显著的，本文基于此阈值将其称为差异关联峰。这些峰显示出性别依赖性模式，雄性大鼠以PCBP1 RNA结合减少为主，雌性大鼠以结合增加为主。PCBP1在RNA上的差异关联位点主要位于内含子区域，映射到参与突触组织、神经元连接性、细胞黏附、谷氨酸能信号传导和髓鞘化相关通路的基因。基序分析鉴定出异质的序列特征，而位置分析显示PCBP1结合区域在剪接位点边界附近富集，支持了其与RNA剪接调控之间的关联。将RIP-Seq与海马体RNA剪接数据整合后，进一步鉴定出在雄性大鼠中也表现出差异剪接的候选PCBP1相关转录本，且这些转录本在突触囊泡循环、神经递质释放和黏附相关通路中富集。

结论

这些发现揭示了乙醇戒断相关的海马体PCBP1 RNA结合变化，并突出了PCBP1相关RNA网络作为酒精戒断期间转录后神经适应的潜在组成部分。更广泛地说，我们的结果表明PCBP1相关RNA调控涉及突触和髓鞘化相关通路，这些通路可能参与酒精戒断期间发生的分子适应过程。