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摘要
CD7是T细胞淋巴恶性肿瘤中嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法的一个有前景的靶点；然而，抗原丢失介导的复发已成为主要挑战。在本研究中，我们系统地分析了10例接受CD7 CAR T细胞治疗的T细胞淋巴瘤/白血病患者的配对标本（治疗前和复发后）的遗传和表观遗传改变。总体而言，我们确定了CD7丢失的三种不同机制：第一，在10例患者中的2例患者中出现移码插入（患者4；c.164dupG:p.R55fs）或缺失（患者7；c.122delG:p.G41Efs*19），导致CD7跨膜域截短；第二，在10例患者中的7例患者中，CD7启动子高甲基化而无CD7突变；第三，在10例患者中的1例患者（患者2）中，启动子区域高甲基化与预测存在功能干扰的多个框内突变同时发生。总体而言，这些发现表明，在CD7 CAR T细胞疗法的选择压力下，克隆异质性和表观遗传可塑性共同驱动了T细胞淋巴恶性肿瘤中的抗原阴性复发。
意义：
了解抗原阴性复发的机制对于开发有效的CD7靶向CAR-T疗法以对抗T细胞淋巴恶性肿瘤至关重要。我们的研究确定了遗传截短突变和表观遗传沉默均为CD7阴性复发的贡献因素。监测和预防这些事件是必要的，以改善治疗效果。
数据可用性
支持本研究发现的数据可在文章及其补充材料中获得。全外显子组测序（WES，10例患者治疗前和复发后的配对样本，共20个样本）的BAM测序数据可向通讯作者索取，并可在GSA-Human数据库中通过登录号HRA018424获取（https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/browse/HRA018424）。
