利用长期废水监测研究西班牙一座中型城市大流行期间及大流行后呼吸道病毒的动态变化

《npj Viruses》：Pandemic and post-pandemic dynamics of respiratory viruses in a Spanish middle-size city using a long-term wastewater surveillance

　　

摘要

本研究利用从西班牙布尔戈斯12个不同地点采集的城市污水样本（n = 600），在3年时间跨度（2021年11月至2024年）内监测了SARS-CoV-2、甲型和乙型流感病毒（Inf）以及A型和B型呼吸道合胞病毒（RSV）的流行情况。采用基于铝盐的吸附沉淀法进行病毒富集和核酸提取，并结合特异性RT-qPCR进行检测。回收率平均为28.73% ± 1.40%，可准确量化病毒含量。结果表明，SARS-CoV-2在整个研究期间于所有采样点均有检出，平均浓度为每10万居民每升污水含6.07 ± 0.04 log基因组拷贝数。此外，SARS-CoV-2浓度水平与报告临床病例之间存在显著相关性，当采用7天提前量时预测能力进一步提高。相比之下，其余呼吸道病毒呈现间歇性流行，检出时浓度较低。从大流行期间到后大流行期间，流感病毒和呼吸道合胞病毒均观察到季节性差异，同时三大病毒组均出现意外的爆发疫情。本研究表明，污水流行病学（WBE）是监测呼吸道病毒（包括特定亚型）的有效工具，并揭示了从大流行期间到后大流行期间SARS-CoV-2的流行情况和季节性变化，以及其对其他呼吸道病毒的潜在影响。